1、法律依据不同。

劳动合同的法律依据是《劳动法》、《劳动合同法》等。聘用合同的法律依据是《关于在事业单位试行人员聘用制度意见的通知》和《事业单位人事管理条例》等。

2、法律关系主体不同。

劳动合同用人单位一方包括企业、事业单位、国家机关，另一方是劳动者。聘用合同用人单位为事业单位，另一方为劳动者。

3、未签订合同的法律后果不同。

根据《劳动合同法》，用人单位超过一个月不满一年未与劳动者签订劳动合同，应当支付劳动者双倍工资，用人单位应当与劳动者签订无固定期限劳动合同而未签订的，应向劳动者支付双倍工资。根据《事业单位人事管理条例》，事业单位未与其聘用的人员签订聘用合同，由县级以上事业单位人事综合管理部门或者主管部门责令限期改正；逾期不改正的，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予处分。

4、试用期期限不同。

劳动合同中的试用期最长不得超过六个月。聘用合同的试用期可以为12个月。

5、用人单位存在处罚权上的不同。

在劳动合同主体上，双方具有同等法律地位，一方无分处分另一方。在聘用合同主体关系上，用人单位可以根据聘用人员错误程度，给予警告、记过、降低岗位等级或者撤职、开除的行政处分。

6、解除合同要求不同。

劳动合同中，用人单位未足额支付劳动报酬、未依法为劳动者缴纳社会保险费等，劳动者可以随时解除劳动合同。而在聘用合同中，用人单位未足额支付劳动报酬、未依法为劳动者缴纳社会保险费等，在事业单位的规定中没有劳动者可以随时解除聘用合同的规定。

7、合同期满是否支付经济补偿金的不同。

按劳动合同法的规定，劳动合同期满，用人单位应按劳动者工作年限支付经济补偿金，而《事业单位人事管理条例》和《关于在事业单位试行人员聘用制度意见的通知》没有聘用合同期满，用人单位支付经济补偿金的规定。

8、管理监督部门不同。

按照各部门的职能分工，劳动合同由人力资源和社会保障部门管理，事业单位除人力资源和社会保障部门管理外，还有分不同类型，则由不同的部门管理，学校归教育部门管理，医院归卫生健康部门管理，等等。

《劳动合同法》第九十六条虽然规定：事业单位与实行聘用制的工作人员订立、履行、变更、解除或者终止劳动合同，法律、行政法规或者另有规定的，依照其规定；未作规定的，依照本法有关规定执行。但是，我认为，此条争议较大，在未对此条作出明确规定之前，不宜对事业单位法律适用问题作出扩大性的解释。

一、我国的用人单位的类型

（1）在中国境内的依法棱准登记的企业：包括各种所有制性质、各种组织形式，如国有企业、集体所有制企业、私营企业、外商投资企业、港澳台企业，混合型企业、股份制企业、联营企业、乡镇企业等。

（2）依法核准登记的个体经济组织。即依法取得营业执照的个体工商户。个体工商户可以请帮手，带学徒。

（3）依法成立的事业单位，包括文化、教育、卫生、科研等各种单位，如学校、医院、出版社等。其在国家法律规定的权限范围内有权使用劳动者。

（4）依法成立的国家机关：它们在法律规定的权限范围内，有权使用劳动者。

（5）依法成立的社会团体：包括工会、妇联、研究会、协会等社会团体组织。依法成立的社会团体在法律规定的权限范围内，有权使用劳动者。