一、补发工资的计税：

1、合并发放多个月的工资。先向税局说明情况，最好有书面说明，向税局说明情况之后，正常申报未按时发放的工资，合并发放工资的当月，把以往应发而未发放的工资剔除，再申报剩余工资的个人所得税。

2、补发以前的工资。需要向税局书面说明，然后把补发的工资，摊回到以前的工资，再计算应缴纳的个人所得税。

法律依据：《中华人民共和国个人所得税法》

第二条下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：

(一)工资、薪金所得;

(二)劳务报酬所得;

(三)稿酬所得;

(四)特许权使用费所得;

(五)经营所得;

(六)利息、股息、红利所得;

(七)财产租赁所得;

(八)财产转让所得;

(九)偶然所得。

居民个人取得前款第一项至第四项所得(以下称综合所得)，按纳税年度合并计算个人所得税;非居民个人取得前款第一项至第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款第五项至第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税。

第三条个人所得税的税率：

(一)综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率(税率表附后);

(二)经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率(税率表附后);

(三)利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，适用比例税率，税率为百分之二十。

补发工资应按照工资、薪金所得项目计征个人所得税。工资、薪金所得应纳的税款，按月计征，即，纳税人月初第一日至月末最后一日，取得的工资、薪金所得，减除费用5000元后，依法计征个人所得税。

也就是说调资后补发以前数月的工资，可以分推到所属月份，与原来的月工资合并计算应缴个人所得税，扣除已缴纳的个人所得税，即为应该补缴的税款。

二、《工资支付暂行规定》

第四条工资支付主要包括：工资支付项目、工资支付水平、工资支付形式、工资支付对象、工资支付时间以及特殊情况下的工资支付。

第五条工资应当以法定货币支付。不得以实物及有价证券替代货币支付。

第六条用人单位应将工资支付给劳动者本人。劳动者本人因故不能领取工资时，可由其亲属或委托他人代领。

用人单位可委托银行代发工资。

用人单位必须书面记录支付劳动者工资的数额、时间、领取者的姓名以及签字，并保存两年以上备查。用人单位在支付工资时应向劳动者提供一份其个人的工资清单。