员工请病假三个月被辞退是否合法，应分情况讨论：

1、若在病假期间或者规定的医疗期间内的，公司是不得解除劳动合同，辞退员工的;

2、但是，若员工非因工负伤或患病，且规定的医疗期结束后仍无法工作的，用人单位可以依据劳动者无法胜任工作来解除劳动合同。

依据《劳动法》

第二十六有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同，但是应当提前三十日以书面形式通知劳动者本人：

(一)劳动者患病或者非因工负伤，医疗期满后，不能从事原工作也不能从事由用人单位另行安排的工作的;

(二)劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的;

(三)劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，致使原劳动合同无法履行，经当事人协商不能就变更劳动合同达成协议的。

补助费相关的规定：

《劳动部办公厅关于对劳部发[1996]354号文件有关问题解释的通知》[1997]18号规定

劳动者患病或者非因工负伤，合同期满终止劳动合同的，用人单位应支付不低于6个月工资的医疗补助费，该医疗补助费是指合同期满的劳动者终止劳动合同时，医疗期满或者医疗终结被劳动鉴定委员会鉴定部分丧失劳动能力的，需向劳动者支付不低于6个月的医疗补助费;对于被鉴定为完全丧失劳动能力的劳动者，且不符合办理退休、退职手续，享受退休、退职待遇的，用人单位也应支付医疗补助费。

企业职工患病或非因工负伤医疗期规定：

《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》第三条

企业职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期：

(一)实际工作年限十年以下的，在本单位工作年限五年以下的为三个月;五年以上的为六个月。

(二)实际工作年限十年以上的，在本单位工作年限五年以下的为六个月;五年以上十年以下的为九个月;十年以上十五年以下的为十二个月;十五年以上二十年以下的为十八个月;二十年以上的为二十四个月。

第四条

医疗期三个月的按六个月内累计病休时间计算;六个月的按十二个月内累计病休时间计算;九个月的按十五个月内累计病休时间计算;十二个月的按十八个月内累计病休时间计算;十八个月的按二十四个月内累计病休时间计算;二十四个月的按三十个月内累计病休时间计算。

第五条

企业职工在医疗期内，其病假工资、疾病救济费和医疗待遇按照有关规定执行。