按每平米征收的。

一是土地竞拍出让时，国土部门在测算土地价格时就将配套费测算进土地出让价格中，土地出让合同价即为土地出让的全部收益;另一种是土地出让时，将土地出让价格拆分成土地出让金、土地补偿费、安置补助费、地上附着物和青苗补偿费、拆迁补偿费、市政建设配套费等分别收取，一般是以协议转让的方式，主要是在安置房、保障房、公共建设等项目会有，市场上更多的是竞拍方式。土地出让收益由财政部门负责管理，国土部门征收。取得土地使用权的约定，只能是体现在一个协议或合同中，其他部门以通知单等名义收取配套费是取得土地使用权行为的另外一种政府收费行为。

契税是以所有权发生转移变更不动产为征税对象，向产权承受人征收的一种财产税。而土地出让金是契税的计算依据，也就是土地出让金里不包括契税。契税是按照出让金的4%计算的。不存在配套费。

配套费主要用于建设项目以外的市政公用配套设施，包括城市主次干道、给排水、供电、供气、路灯、公共交通、环境卫生和园林绿化等项目的建设和维护，是市政基础设施建设资金的补充，与各项城市建设资金合并部分收费项目，适当降低收费标准。

房屋的配套费是怎么算的

已征收城市污水处理费的地区，不得再征收城市排水设施有偿使用费。将现行“工程定额编制管理费”和“工程劳动定额测定费”合并为“工程定额测定费”，收费标准按照建安工作量的0.4‰-1.4‰收取，西部地区建安工作量较小的城市最高不超过1.5‰。降低政府部门收取的征地管理费、房屋拆迁管理费、工程质量监督费、劳动合同鉴证费、建筑合同鉴证费、工程承包合同鉴证费，收费标准均按现行收费标准的70%计收，并由省级价格、财政部门逐项予以重新核定。按照从严控制住房建设收费的原则，改革白蚁防治费、地震安全性评价费、核设施环境影响评价费、房屋所有权登记费等收费项目的计费方式，重新核定收费标准，具体办法由国家计委、财政部另行制定。整顿规范住房交易服务收费。勘察设计、工程监理、房地产评估、委托拆迁服务等经营服务性收费要坚持自愿委托的原则，严格按规定的收费办法执行。

拆迁补偿费、配套费的契税缴纳时间

《国有土地使用权出让合同》中包含拆迁补偿费、市政建设配套费等费用及其金额的，其拆迁补偿费、市政建设配套费等费用的纳税义务发生时间为签订《国有土地使用权出让合同》的当天。《国有土地使用权出让合同》中未包含拆迁补偿费、市政建设配套费等费用的，市政建设配套费等费用的纳税义务发生时间为通知缴纳市政建设配套费等费用的文件发文时间;市政建设配套费等费用没有通知缴费文件的，其纳税义务发生时间为纳税人取得的上述费用收缴凭证开具的当天。