1、在使用将工程款直接打到承包方指定的账户时，在每次打款时应该留有票据，在留有票据的情况下，一但出现问题可以根据票据取证。

2、在使用将工程款直接打给个人的请况时，应注意与这个指定的人履行委托授权手续，此手续应咨询有关人员，需要履行规范的手续。许多问题的发生是因为在签署委托授权手续时不够规范，让一些心存不轨的委托人钻了法律的空子，从而让他们逍遥法外。在这里需要向指定的人员开据规范的收款凭据，并且收款日期、收款金额与实际中的要相符。

3、使用第三方方式支付时，需要签订规范的书面协议，每次打款需要有完备的凭据，还需要在行政机关或者司法机关的组织协调下进行，以免被第三方恶意诈骗而造成无法估量的损失。

4、一些房地产企业在不能够支付资金的情况下会选择使用房屋抵债，只是在使用此方式时，并不是单纯的交换模式，是需要开发商与购房人签订一些合同并开具一些有效的发票的，只是由于价格上的不能妥协和房屋在开盘后的不定因素容易造成纠纷。

不得不说，在支付工程合同价款的过程中，可能会出现各种意外情况。要是事先当事人并没有留存什么证据的话，那在纠纷发生之后就有可能导致自身合法权益受到损害，造成无法估量的损失。而工程合同价毕竟是当事人事先约定的一个价格，实践中有可能会增加或者减少。当事人可以事先约定如果出现这类情况，还是按照工程合同价款支付还是按照实际发生的价款支付。

一、工程合同的价款包括了哪些

工程款按支付阶段不同通常可分为预付款、进度款、竣工结算款和质保金。

1、预付款。预付款指开工前发包人应预付给承包人用于为合同工程施工准备的款项。施工准备事项包括购置材料、工程设备、施工设备、修建临时设施以及组织施工队伍进场等。预付款比例一般不低于合同金额的10%，不高于合同金额的30%。

2、进度款。进度款指施工期间发包人根据工程完成情况应支付给承包人的一种工程价款。在工程实践中，发包人同意支付进度一般为合同价的70%，进度款有三种支付方式：

(1)按形象进度分阶段支付;

(2)是按照已完工程量分期间支付;

(3)是按照阶段及期间混合支付。

3、结算款。结算款，即竣工结算款，指工程竣工结算后发包人应该支付给承包人的除质保金外的剩余工程价款。竣工结算款等于竣工结算价减去质保金和已付款后的金额。竣工结算款支付的前提条件是工程竣工验收合格。