适用。

《关于调整个人取得全年一次性奖金等计算征收个人所得税方法问题的通知》(国税发〔2005〕9号)第一条第一款规定，全年一次性奖金是指行政机关、企事业单位等扣缴义务人根据其全年经济效益和对雇员全年工作业绩的综合考核情况，向雇员发放的一次性奖金。

参照《关于印发个人所得税征税业务指引(一)的通知》(穗地税发〔2005〕160号)第一条第(一)项规定，对全年任职不足12个月的雇员，其取得的全年一次性奖金的计税办法，按照《国家税务总局关于调整个人取得全年一次性奖金等计算征收个人所得税方法问题的通知》(国税发〔2005〕9号，以下简称“9号文”)第二条第(一)款的规定执行。

根据上述规定，员工虽入职未满一年，但领到的也是年终奖，可以按照全年一次性奖金计算扣缴个人所得税，计税方法与其他员工一样，可以除以12个月，按其商数确定适用税率。

建议处理之前与主管税务机关进一步沟通确认。

一、公司分红个人所得税计算公式

1、先将雇员当月取得的全年一次性奖金，除以12个月，按其商数确定适用税率和速算扣除数。

如果当月工资薪金所得低于法定扣除费用额时，应将全年一次性奖金减除雇员当月工资薪金所得与法定扣除费用的差额后的余额，按上述办法确定适用税率和速算扣除数。

2、将雇员当月取得的全年一次性奖金，按第1项确定的适用税率和速算扣除数计算征税。

在一个纳税年度内，对每一个纳税人，该计税办法只允许采用一次。雇员取得除全年一次性奖金以外的其它各种名目奖金，如半年奖、季度奖、加班奖、先进奖、考勤奖等，一律与当月工资、薪金收入合并，按税法规定缴纳个人所得税。个人实行年终双薪、年薪制的，应按全年一次性奖金办法计缴个人所得税。

二、年终奖是和工资一起发吗

1、首先，目前我国法律没有关于年终奖的具体规定。年终奖发放属于用人单位自主管理范畴，用人单位有权决定年终奖的发放条件和方式。

2、其次，年终奖是和工资可以一起发，也可以单独发，但是会对税费有影响。

3、最后要注意的是，个人取得年底双薪，如果其单位没有发放全年一次性奖金，可以按照全年一次性奖金计税办法计税。如果其单位既有年底双薪，又有全年一次性奖金，并且二者在同一个月内发放，可以将年底双薪与全年一次性奖金合并；如果二者不在同一个月份内发放，应将年底双薪并入当月工资、薪金，统一计算个人所得税。