房地产项目进行工程款清算的，会产生比较多的费用，具体有哪些费用由清算的方式等实际情况而定。建设工程价款结算是指对建设工程的发承包合同价款进行约定和依据合同约定进行工程预付款、工程进度款、工程竣工价款结算的活动。

工程价款结算应按合同约定办理，合同未作约定或约定不明的，发、承包双方应依照下列规定与文件协商处理：

1、国家有关法律、法规和规章制度；

2、国务院建设行政主管部门、省、自治区、直辖市或有关部门发布的工程造价计价标准、计价办法等有关规定；

3、建设项目的合同、补充协议、变更签证和现场签证，以及经发、承包人认可的其他有效文件；

4、其他可依据的材料。

一、房地产项目清算费用条件

因房地产项目时间比较长，大部分房地产企业是按预收款的一定的比例预交的土地增值税。土地增值税项目清算，就是对符合清算条件的项目进行清算。

1、凡符合下列情况之一的，纳税人应到主管地方税务机关办理土地增值税清算手续：

（1）全部竣工并销售完毕的房地产开发项目。

（2）整体转让未竣工的房地产开发项目。

（3）直接转让土地使用权的项目。

（4）纳税人申请注销税务登记的房地产开发项目。

2、符合下列情况之一的，主管地方税务机关可要求纳税人进行土地增值税清算：

（1）纳税人开发的房地产开发项目已通过竣工验收，在整个预（销）售的房地产开发建筑面积达到可销售总建筑面积的比例85％（含）以上的。

（2）取得销售（预售）许可证满三年仍未销售完毕的。

（3）经主管地方税务机关进行纳税评估发现问题后，认为需要办理土地增值税清算的房地产开发项目。

相关法律规定：

《建设工程价款结算暂行办法》

第十一条：工程价款结算应按合同约定办理，合同未作约定或约定不明的，发、承包双方应依照下列规定与文件协商处理：

（一）国家有关法律、法规和规章制度；

（二）国务院建设行政主管部门、省、自治区、直辖市或有关部门发布的工程造价计价标准、计价办法等有关规定；

（三）建设项目的合同、补充协议、变更签证和现场签证，以及经发、承包人认可的其他有效文件；

（四）其他可依据的材料。