公司与员工签订的劳动合同不是必须要到相关部门备案的，劳动合同备案制度是属于可选择的事项，就象一般的民事协议进行公证一样，不是必备的条件。所以不进行备案，是没有什么影响的，更谈不上任何处罚。

《中华人民共和国劳动合同法》

第十六条劳动合同由用人单位与劳动者协商一致，并经用人单位与劳动者在劳动合同文本上签字或者盖章生效。

劳动合同文本由用人单位和劳动者各执一份。

一、用人单位不签订劳动合同劳动者怎么办

如果用人单位不与劳动者签订劳动合同，劳动者在劳动关系存续期间，应注意搜集并保存双方成立劳动关系的有关证据，比如：

1、用人单位招聘时要求劳动者填写的报名表、登记表等招用记录。

2、用人单位收取劳动者押金或扣押劳动者工资而出具的押金条、扣押条等各种票据。

3、用人单位给劳动者发放的工作证、服务证、门卡等各种工作证件。

4、用人单位给劳动者发放的工资卡或其他工资支付凭证。

5、用人单位给劳动者发放的工作服、饭卡等与用人单位有关的东西。

6、职工的工资表、考勤记录、值班表、任命书、解除合同通知书、辞退通知书等各种加盖有用人单位公章的文件。

二、没有劳动合同工伤怎么办理

1、向人力资源和社会保障局（原劳动局）申请工伤认定，公司需要在事故发生的一个月内申报，如果公司不申请，则工伤职工或者其近亲属在一年内提出认定申请。需提交材料：工伤认定申请表（人社局的网站一般有下载）、与用人单位存在劳动关系的证明材料、医疗诊断证明等。

2、如果经过治疗伤情相对稳定后存在残疾、影响劳动能力的，应当申请劳动能力鉴定，向设区的市级劳动能力鉴定委员会提出申请（一般设立在同级人力资源和社会保障局）。

3、根据不同的伤残等级，获得的补偿是不一样的。主要的补偿是：医疗费、一次性伤残补助金、一次性就业补助金、一次性医疗补助金、停工留薪期工资、伙食补助费、护理费等。

4、如果没有劳动合同及其他证明存在劳动关系的证据，无法申请工伤认定，可以先申请劳动仲裁确认与用人单位之间存在劳动关系。经过劳动仲裁确认存在劳动关系后，再申请工伤认定。