加班工资的举证责任有劳动者承担，劳动者主张加班费的，应当就加班事实的存在承担举证责任。但劳动者有证据证明用人单位掌握加班事实存在的证据，用人单位不提供，由用人单位承担不利后果。

一、劳动争议的证据提供

1、非合同关系证据

根据新《劳动争议调解仲裁法》第6条规定，发生劳动争议，当事人对自己提出的主张有责任提供证据。与争议事项有关的证据属于用人单位掌握管理的，用人单位应当提供；用人单位不提供的，应当承担不利后果。依据最高人民法院《关于审理劳动争议案件适用法律若干问题的解释》第13条对用人单位在劳动争议中举证责任作了明确规定，即用人单位作出的开除、除名、辞退、解除劳动合同、减少劳动报酬、计算劳动者工作年限等决定而发生的劳动争议，用人单位负举证责任。

2、合同关系证据

另外依据劳动保障部《关于确立劳动关系有关事项的通知》的规定，在处理确认用人单位与劳动者是否存在事实劳动关系的劳动争议时，涉及到工资支付凭证或记录、缴纳各项社会保险费的记录、招工登记表报名表、考勤记录等有关凭证均由用人单位负举证责任。既然法律规定了用人单位主动承担举证责任的内容，这就要求用人单位在平时的工作当中就应当注意保存相关的证据，尤其是用人单位负举证责任范围内的证据，避免在发生劳动争议后由于举证不能承担败诉的后果。

二、谁承担证明加班事实的举证责任

《司法解释(三)》第9条规定：劳动者主张加班费的，应当就加班事实的存在承担举证责任。但劳动者有证据证明用人单位掌握加班事实存在的证据，用人单位不提供的，由用人单位承担不利后果。

劳动者加班又没有加班费这个问题一直是我国劳动法司法审判领域的一个难点，有观点认为加班事实的举证责任在用人单位，因为用人单位有保存考勤记录的法定责任。也有观点认为加班事实应根据民事诉讼的“谁主张谁举证”原则进行确定。

本条司法解释出台，一方面明确了加班事实举证责任的分配，另一方面也为尽可能保护劳动者权益留了一点小尾巴：“但劳动者有证据证明用人单位掌握加班事实存在的证据，用人单位不提供的，由用人单位承担不利后果。”

但总的来看，未来一段时间内，劳动者如要向用人单位主张支付加班费，需要在工作期间注意搜集维权证据，比如真实有效的考勤记录、签到打卡表格等相关材料。

然而，此次《司法解释(三)》的出台，企业并不能轻视加班费的管理。企业仍应进一步建立健全工时、工资和考勤休假制度，通过制度规定和合同约定来有效预防加班费支付事项上的法律风险。

三、关于在劳动仲裁诉讼中的举证责任如何划分

劳动者在劳动争议诉讼中承担的举证责任：

(一)劳动者主张工资标准应当高于劳动合同约定或已实际领取的工资数额，劳动者应就其主张的工资标准举证；

(二)劳动者主张用人单位减少劳动报酬的，应就用人单位减少劳动报酬的事实举证；

(三)劳动者主张订立无固定期限劳动合同的，由劳动者就订立无固定期限劳动合同条件成立举证；

(四)劳动者主张工伤赔偿的，应就存在因工伤害的事实及工伤认定、伤残等级及鉴定时间、工伤住院治疗起止时间及费用、同意转院治疗的证明及所需交通费和食宿费、应安装康复器具的证明及费用等举证。

用人单位在劳动争议诉讼中应承担的举证责任：

(一)劳动者己举证证明在用人单位处提供劳动，但用人单位主张劳动关系不成立的，用人单位应当提交反证；

(二)用人单位应就劳动者已领取工资的情况举证；

(三)用人单位延期支付工资，劳动者主张用人单位系无故拖欠工资的，用人单位应就延期支付工资的原因进行举证；

(四)劳动者主张加班工资的，用人单位应就劳动者实际工作时间的记录举证；

(五)双方当事人均无法证明劳动者实际工作时间的，用人单位就劳动者所处的工作岗位的一般加班情况举证；

(六)用人单位减少劳动者劳动报酬，应就减少劳动报酬的原因及依据举证。