在疫情期间只要劳动者没有做出不合法的事情，那么就不应该扣工资，而对于只要因为疫情不能上班就不能扣工资，从而还应该要如实的发放劳动者该有的工资，所以，在处理的时候就要结合实际的情况来进行办理。

一、公司让在家办公合法吗

如果公司在疫情期间没有得到当地政府的许可就复工，并且要求劳动者正常上班，侵犯了劳动者的合法权益，劳动者可以与公司协商或者申请劳动仲裁，还可以向劳动行政部门举报。如果公司在疫情期间复工得到了当地政府的许可，要求劳动者上班，劳动者应该听从公司的安排。

二、扣工资的哪些行为是违法的

扣工资的违法行为有：

一、上班迟到。

最常见的扣工资就是上班迟到了，法律上允许企业针对一些员工的迟到行为扣除部分考勤工资。但是如果达到了超出日薪的罚款额度则肯定是不合法的。

二、产检。

怀孕的女职工在工作期间进行产检，检查期间的工资要照常发放，不能按照病假、事假或者旷工折算。如果还有企业因为员工产检而进行罚款，则属于明确的违法行为。

三、辞职。

根据《劳动法》规定，工资应当以货币的形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或无故拖欠。有些公司为了保证员工的留存率，会拖欠员工工资，这种行为当属违法。

四、绩效。

用人单位在和劳动者签订用工合同时，一般会把基本工资和绩效工资分开计算。基本的固定工资是不能扣除的，绩效工资严格来书类似于奖金，是可以根据员工的工作成绩来决定发放份额。如果因为绩效未达标，就扣除基本工资部分，显然是不合法的。

五、损失。

如果劳动者因为个人工作的失误给公司造成了财产损失，公司是有权根据损失的数额，分月扣除员工部分工资的，但是每月扣除额度最高不得超过劳动者当月工资的百分之二十。如果扣除之后的工资要低于当地的平均工资，则按照最低工资标准结算。

三、旷工离职工资怎么算

员工无故旷工超过15天，企业是可以直接开除的，这样的情况，企业可以不用赔付其经济补偿金，只要将其本月上班时间的工资结算给他即可。如果公司的规章制度有要求旷工扣除奖金的，只要规章制度是集团同意的并进行了公示，那么企业就可以按照规章制度按比例来扣除其本月奖金。如果规章制度没有要求，企业是没有资格扣工资的。