一、工伤赔偿协议签订后还能不能向法院起诉

当事人双方协商达成的，达成协议不履行的，或者协议未经工伤认定、劳动能力鉴定前提下作出，或者协议存在欺诈、胁迫、乘人之危和显失公平的，可以申请劳动争议仲裁，对仲裁裁决不服可以向人民法院提起诉讼；经劳动争议仲裁委员会调解达成协议的，协议书已经送达发生法律效力，不可以起诉，但可以申请再审。

《工伤保险条例》

第五十四条职工与用人单位发生工伤待遇方面的争议，按照处理劳动争议的有关规定处理。

《劳动争议调解仲裁法》

第五条发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解；不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。

第四十二条仲裁庭在作出裁决前，应当先行调解。

调解达成协议的，仲裁庭应当制作调解书。

调解书应当写明仲裁请求和当事人协议的结果。调解书由仲裁员签名，加盖劳动争议仲裁委员会印章，送达双方当事人。调解书经双方当事人签收后，发生法律效力。

调解不成或者调解书送达前，一方当事人反悔的，仲裁庭应当及时作出裁决。

二、工伤赔偿协议起诉后是合同关系吗

根据《民法典》的相关知识我们可以看出，工伤赔偿协议本身就是合同关系，它具有合同的特性并对双方有着约束力，这种约束并不具有法律上的强制性，而起诉并不当然的决定着协议的合同性质。变更合同的性质的情形有：

第一，由合同性质和内容决定当事人一方可变更合同。有的合同是为当事人一方的利益而设立的；也有一些合同的某些条款是专为当事人一方利益约定的。由于在一般情况下，当事人可以放弃自己应得的利益，因此，对于这些合同，如果当事人一方在订立合同后根据客观情况的变化，不再需要合同为其带来利益，则可以变更合同。

第二，当事人双方经协商同意，并且不因此损害国家利益和社会公共利益。当事人双方在进行协商时，意思表示必须是明确的，而不能是模糊的，否则，当事人对合同变更的内容约定不明确的，推定为未变更。

第三，由于不可抗力致使合同的全部义务不能履行。不可抗力是指不能预见或者不能避免、不能克服的客观情况。发生不可抗力，造成合同不能履行或者不能完全履行时，允许当事人变更合同，使合同的履行成为可能。不可抗力必须达到使合同无法履行的程度，才能作为变更合同的理由。如发生不可抗力后，经义务人的努力，合同仍可履行，则不能作为合同变更的理由。

就算因此起诉，工伤赔偿协议的本质不会因此而改变，它就是合同关系。

《工伤保险条例》（2010修订）：第五章　工伤保险待遇　　第四十二条　工伤职工有下列情形之一的，停止享受工伤保险待遇：\n（一）丧失享受待遇条件的；\n（二）拒不接受劳动能力鉴定的；\n（三）拒绝治疗的。