工资超过5000扣税是扣百分之十，工资超过5000扣税的税率是百分之三至百分之四十五左右。工资超过5000会被扣税，我国个人所得税扣税的起征点是五千元。

一、工资超过5000扣税是扣多少

工资超过5000元扣税的话税率一般是10％的税率。工资超过5000部分适用3％—45％的超额累进税率进行扣税。应纳税所得额＝工资收入金额－各项社会保险费－起征点（5000元）。应纳税额＝应纳税所得额x税率－速算扣除数。

《个人所得税法》第二条，下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：

（一）工资、薪金所得；

（二）劳务报酬所得；

（三）稿酬所得；

（四）特许权使用费所得；

（五）经营所得；

（六）利息、股息、红利所得；

（七）财产租赁所得；

（八）财产转让所得；

（九）偶然所得。

二、工资超过5000会扣税吗

工资超过5000扣税，是要缴纳个人所得税的，目前的起征点是5000元，超过的部分才纳税。《财政部税务总局关于2018年第四季度个人所得税减除费用和税率适用问题的通知》第一条、关于工资、薪金所得适用减除费用和税率问题对纳税人在2018年10月1日（含）后实际取得的工资、薪金所得，减除费用统一按照5000元／月执行，并按照本通知所附个人所得税税率表一计算应纳税额。对纳税人在2018年9月30日（含）前实际取得的工资、薪金所得，减除费用按照税法修改前规定执行。

三、发工资扣税是怎么扣税的

发工资扣税方法为由企业进行核算，并在发放给职工前进行代扣代缴，然后统一到当地地税局申报缴纳。工资扣税等于全月应纳税所得额＊税率－速算扣除数全月应纳税所得额。居民个人综合所得应纳税额的计算公式应为：人应纳税额＝个人全年应纳税所得额×适用税率－速算扣除数＝（全年收入额－60000元－社保、住房公积金费用－享受的专项附加扣除－享受的其他扣除）×适用税率－速算扣除数。

《中华人民共和国个人所得税法》（2018修正）：　第二条　下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：\n（一）工资、薪金所得；\n（二）劳务报酬所得；\n　　（三）稿酬所得；\n（四）特许权使用费所得；\n（五）经营所得；\n（六）利息、股息、红利所得；\n（七）财产租赁所得；\n（八）财产转让所得；\n（九）偶然所得。\n居民个人取得前款第一项至第四项所得（以下称综合所得），按纳税年度合并计算个人所得税；非居民个人取得前款第一项至第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款第五项至第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税。