竞业限制协议在侵犯商业秘密纠纷中的作用如下：

1、竞业限制协议是用人单位对其商业秘密采取的一种保护措施；

2、可以作为证明被告行为存在违法性的证据；

3、可以作为证明被告过错程度的证据。

一、员工违反保密协议的处理方式有哪些

1、员工违反保密协议的，处理的方式如下：

(1)、员工违反保护协议的，员工要承担民事责任，依据保密协议赔偿违约金；

(2)、违反保密协议侵犯单位商业秘密的，给用人单位造成损失的，要承担赔偿的责任；

(3)、违反保密协议，侵犯公司商业秘密，情节严重的，可能构成侵犯商业秘密罪，要承担刑事责任。

2、法律依据：

《中华人民共和国劳动合同法》第二十三条【保密义务和竞业限制】

《中华人民共和国刑法》第二百一十九条【侵犯商业秘密罪】

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二、如何领取竞业限制补偿金

1、用人单位与负有保守用人单位商业秘密义务的劳动者在竞业限制协议中对经济补偿金的标准、支付形式有约定的，从其约定。因用人单位原因不按协议约定支付经济补偿金，经劳动者要求仍不支付的，劳动者可以解除竞业限制协议。

2、竞业限制协议对经济补偿金的标准、支付形式等未作约定的，劳动者可以要求用人单位支付经济补偿金。双方当事人由此发生争议的，可按劳动争议处理程序解决。用人单位要求劳动者继续履行竞业限制协议的，应当按劳动争议处理机构确认的标准及双方约定的竞业限制期限一次性支付经济补偿金，劳动者应当继续履行竞业限制义务；用人单位放弃对剩余期限竞业限制要求的，应当按劳动争议处理机构确认的标准支付已经履行部分的经济补偿金。

3、竞业限制协议生效前或者履行期间，用人单位放弃对劳动者竞业限制的要求，应当提前一个月通知劳动者。

三、竞业协议补偿金怎么发放

竞业限制是通过对劳动者自由择业权利进行一定程度的制约来保护商业秘密的一种手段，制约的对象包括在职职工和离职职工。对在职职工而言，竞业限制属于默示的法律义务，对离职职工而言，则必须来源于竞业限制协议的设定，而竞业限制协议的签订一般要以用人单位支付一定的补偿金为代价。

竞业限制经济补偿金的支付既有法律强制性规定，也存在约定为主，法定为辅的内容。具体来说，可以从以下三个方面来概括：

1、在支付时间上法定

法律有明确的规定，即竞业限制补偿金的支付在终止或者解除劳动合同后。《劳动合同法》第三十二条第二款规定，对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。我们认为”约定在终止或者解除劳动合同后，给予劳动者经济补偿”属于法律的强制性规定，法律已经对当事人约定经济补偿的支付时间给予了强制界定。

2、支付标准和支付形式

我国的关于劳动方面的法律法规并没有明确规定竞业限制的补偿标准和支付方式，仅有司法解释作支撑。因此，当事人可以约定的是经济补偿金支付的标准和支付形式，若无约定或约定不明就适用司法解释。

3、对支付标准仅有司法解释，法律尚无明确规定

根据我国审理劳动争议案件的相关司法解释，当事人在劳动合同或者保密协议中约定了竞业限制，但未约定解除或者终止劳动合同后给予劳动者经济补偿，劳动者履行了竞业限制义务，要求用人单位按照劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月平均工资的30%按月支付经济补偿。