根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，刑事自诉案件的处理如下：

受害人向有管辖权的人民法院提起自诉，并上交相关证据。

人民法院对于自诉案件进行审查后，按照下列情形分别处理：

犯罪事实清楚，有足够证据的案件，应当开庭审判。

缺乏罪证的自诉案件，如果自诉人提不出补充证据，应当说服自诉人撤回自诉，或者裁定驳回。

自诉案件的被告人在诉讼过程中，可以对自诉人提起反诉。人民法院对自诉案件，可以进行调解；自诉人在宣告判决前，可以同被告人自行和解或者撤回自诉。但被害人有证据证明被告人侵犯自己的人身、财产权利的行为应当依法追究刑事责任，而公安机关或者人民检察院不予追究被告人刑事责任的案件除外。

人民法院审理自诉案件的期限，被告人被羁押的，应当在受理后二个月内宣判，至迟不得超过三个月。未被羁押的，应当在受理后六个月内宣判。

一、怎么申请刑事自诉

提起自诉，被害人或其法定代理人、近亲属以及他们的诉讼代理人在法定的起诉时效期限内，可以用书面或口头的方式直接向有管辖权的人民法院提出。

自诉一般用书面的形式，即应当制作并向法院呈递刑事自诉状。但是，自诉人书写自诉状确有困难的，可以口头告诉，由人民法院工作人员作出告诉笔录，向自诉人宣读，自诉人确认无误后，应当签名或盖章。

二、刑事自诉案件的级别管辖

依据我国相关法律的规定，刑事自诉案件一般是由犯罪行为发生地基层人民法院负责管辖的，但如果是重大复杂的案件，应该移送到中级法院受理。

相关法律规定

《最高人民法院关于适用刑事诉讼法>的解释》

第一条人民法院直接受理的自诉案件包括：

（一）告诉才处理的案件：

1、侮辱、诽谤案（刑法第二百四十六条规定的，但严重危害社会秩序和国家利益的除外）；

2、暴力干涉婚姻自由案（刑法第二百五十七条第一款规定的）；

3、虐待案（刑法第二百六十条第一款规定的）；

4、侵占案（刑法第二百七十条规定的）。

（二）人民检察院没有提起公诉，被害人有证据证明的轻微刑事案件：

1、故意伤害案（刑法第二百三十四条第一款规定的）；

2、非法侵入住宅案（刑法第二百四十五条规定的）；

3、侵犯通信自由案（刑法第二百五十二条规定的）；

4、重婚案（刑法第二百五十八条规定的）；

5、遗弃案（刑法第二百六十一条规定的）；

6、生产、销售伪劣商品案（刑法分则第三章第一节规定的，但严重危害社会秩序和国家利益的除外）；

7、侵犯知识产权案（刑法分则第三章第七节规定的，但严重危害社会秩序和国家利益的除外）；

8、刑法分则第四章、第五章规定的，对被告人可能判处三年有期徒刑以下刑罚的案件。

本项规定的案件，被害人直接向人民法院起诉的，人民法院应当依法受理。对其中证据不足、可以由公安机关受理的，或者认为对被告人可能判处三年有期徒刑以上刑罚的，应当告知被害人向公安机关报案，或者移送公安机关立案侦查。

（三）被害人有证据证明对被告人侵犯自己人身、财产权利的行为应当依法追究刑事责任，且有证据证明曾经提出控告，而公安机关或者人民检察院不予追究被告人刑事责任的案件。

第十五条基层人民法院对可能判处无期徒刑、死刑的第一审刑事案件，应当移送中级人民法院审判。