先是在国税网上申请办理注销，然后等国税批准。拿到国税批准注销的文件，到地税去注销，然后再到公司注册的工商局办理申请营业执照的注销，然后再注销组织代码。

1、原来这些资产、负债和费用是属于总公司,现在还是总公司,要处理还有问总公司意见。

2、非独立核算的,不要清算.除非总公司要进行内部清算。

3、从开业到现在因为没有业务在当地税务局只交个人所得税其它都是零申报的，这种情况要注销的话,必须与当地税务局办理分公司税务注销手续,可能税务要求你进行注销税务审计。

如何办理公司注销税务

首先，老板携带相关资料到办税服务厅提出税务登记注销申请，填写《清税申报表》，在当地缴纳企业所得税的老板还需要填制《中华人民共和国企业清算所得税申报表》及附表。

其次，税务检查部门确定老板没有重大违法行为后，将检查报告推送回办税服务厅。

税务人员通知老板把存在的应纳税款、多退(免)税款以及滞纳金、罚款等款项结清。

老板携带发票领购簿、未开具的空白发票及税控设备到办税服务厅，窗口工作人员把已开具的发票验旧、未开具的发票缴销，收回发票领购簿及税控设备，确保票款两清，没有遗漏。

最后，税务人员根据国税、地税清税结果，确认老板结清所有税务事项后，将老板在税收征管系统内的做注销处理，并向老板出具《清税证明》，一式三份，交给老板一份，提示其凭《清税证明》办理工商登记注销。

税务机关同时将清税信息推送到工商、质检、国税与地税等部门的信息共享交换平台。

“三证合一、一照一码”的企业税务注销流程就此结束。而公司签署的委托划款协议、防伪税控等服务单位之间的业务往来，只要公司在税务局注销了税务登记，就不需要再与服务单位交涉了。

注意!《清税证明》是办理注销的必备资料

持“三证合一、一照一码”的企业，申请公司注销的税务部分时，可向国税、地税任何一方税务主管机关提出清税申请。

税务机关受理后会将企业清税申请信息同时传递给另一方税务机关，由双方按照各自职责分别清税，限时办理。

清税完毕后一方税务机关及时将本部门的清税结果信息反馈给受理税务机关，由受理税务机关根据国税、地税清税结果向老板统一出具《清税证明》，并将信息共享到交换平台。