可以这样保护中小股东的合法权利：

1、中小股东可以通过单独或者联合行使召集和主持股东会会议的权利，以维护自己的合法权益；

2、中小股东有权依法转让自己的股权；

3、股权优先购买权，这是所有股东享有的一项特权。

一、股东想退出法人不同意该怎么办

股东想退出法人不同意的处理办法如下：

1、股东可通过将股权转让给其他股东，以此退出公司；

2、股东可通过其他过半数股东的同意，将股份转让给除股东外的其他人，来达到退出法人的目的；

3、符合特定条件的，股东可要求公司回购股份，实现退出法人的目的。

有股东不同意转让的办法：

1、股东向公司内的其他股东转让股权：如果公司股东间互相转让股权，那么转让是不需要公司其他股东的同意的，股东可以自己决定要转让给哪个股东，以及转让多少股权。

2、股东向股东以外的人转让股权，首先，转让股权的股东应该将转让事项书面通知其他股东，其他股东应在三十日内答复：

（1）其他股东在三十日内未答复视为同意转让；

（2）其他股东过半数同意转让的，此时在同等条件下其他股东有优先购买权。

有限责任公司是股东基于彼此的信赖而建立起来的，兼有资合与人合的特点，为了维持公司股东彼此信赖的需要、公司内部的稳定性，保持股东间良好的合作关系，股东在转让股权时，应首先考虑在公司现有的股东间进行。只有在其他股东都不行使优先购买权的情况下，要转让股权的股东才能将该股权转让给股东以外的人。应该注意的是，如果两个以上股东主张行使优先购买权的，协商确定各自的购买比例，协商不成的，按照转让时各自的出资比例行使优先购买权。

（3）如果过半数不同意转让的，则不同意转让的股东应购买该转让股权；不购买则视为同意转让。既不同意转让，也不购买该股权的，应当视为同意转让，应当配合该股权转让行为。

3、另外，需要注意的是，公司章程如果对公司股权转让有作出明确规定的，还需参照公司章程进行具体分析。

二、有限责任公司的出资转让限制有哪些

有限责任公司的出资转让限制如下：

1、内部转让限制条件：股东可以在未经股东会同意的情况下自由转让其全部或部分股权；股东原则上可以自由转让其全部或部分股权，但公司章程可以在股东之间增加其他股权转让条件；股东之间股权转让必须经股东会同意；

2、外部转让限制条件：必须符合法律规定才能有效。

《中华人民共和国公司法》规定，有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，其他股东自接到书面通知之日起满三十日未答复的，视为同意转让。其他股东半数以上不同意转让的，不同意的股东应当购买该转让的股权；不购买的，视为同意转让。经股东同意转让的股权，在同等条件下，其他股东有优先购买权。两个以上股东主张行使优先购买权的，协商确定各自的购买比例；协商不成的，按照转让时各自的出资比例行使优先购买权。公司章程对股权转让另有规定的，从其规定。

三、非上市公司股东如何退股

非上市公司股东退股有两个方法：一、转让股权《公司法》第七十一条规定，有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，其他股东自接到书面通知之日起满三十日未答复的，视为同意转让。其他股东半数以上不同意转让的，不同意的股东应当购买该转让的股权;不购买的，视为同意转让。经股东同意转让的股权，在同等条件下，其他股东有优先购买权。两个以上股东主张行使优先购买权的，协商确定各自的购买比例;协商不成的，按照转让时各自的出资比例行使优先购买权。公司章程对股权转让另有规定的，从其规定。二、请求公司按合同价格收购其股权《公司法》第七十四条规定，有下列情形之一的，对股东会该项决议投反对票的股东可以请求公司按照合理的价格收购其股权：(一)公司连续五年不向股东分配利润，而公司该五年连续盈利，并且符合本法规定的分配利润条件的;(二)公司合并、分立、转让主要财产的;(三)公司章程规定的营业期限届满或者章程规定的其他解散事由出现，股东会会议通过决议修改章程使公司存续的。自股东会会议决议通过之日起六十日内，股东与公司不能达成股权收购协议的，股东可以自股东会会议决议通过之日起九十日内向人民法院提起诉讼。