单位犯罪违法所得的处理为：对于单位犯罪所留下来的违法所得的话，这个一般会进行追缴或者是索赔以及上缴给国库等操作，总之在这个案件中，自己得到的所有违法所得都不是自己的。对于单位犯罪，人民法院是需要实行双罚制的。需要追究单位负责人的刑事责任，同时需要对单位处以罚金。

一、单位犯罪单罚制双罚制的概念主要是

单位犯罪是指公司、企业、事业单位、机关、组织为单位谋取利益，由单位决策机构或者负责人决定实施的，法律规定应当承担刑事责任，危害社会的行为。这里的单位犯罪包括法人犯罪和非法人犯罪。

我国对单位犯罪的处罚主要是双罚制，单罚制为辅。

1、所谓双罚制，是指对单位犯罪的主管人员和其他直接责任人员，人员和其他直接责任人员判处罚金。对绝大多数单位犯罪实行双罚制；

2、所谓单一处罚制度，是指对单位犯罪的，不判处单位罚款，只对主管人员和其他直接责任人员直接负责。

二、诈骗公司员工会如何处理

根据《刑法》相关的规定，单位犯罪的，对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员判处刑罚。对于一般的单位犯罪而言，法律只追究主要负责人和直接负责人，员工一般是不会受到刑事追究的，但是也不能一概而论。涉案员工会受到刑事调查，但是否会承担刑事责任，要根据具体情况而定，需要根据该员工在单位中担任的角色、实施的行为、以及在犯罪过程中起到的作用等因素来确定。如果确定其是从犯，或者胁从犯，应当依法从轻或免于处罚。同时，如果成立公司的目的就是为了诈骗，员工明知犯罪而参与其中的都要承担相应的责任，主要考虑的地方有两点：1、是否知道或者应当知道公司从事的是违法犯罪。2、自己有没有获得很高的报酬，即明显高于普通员工工资的情况。

三、公司该怎样承担刑事责任

一般对直接负责的主管人员和直接责任人员处以刑罚。单位犯罪是指公司、企业、事业单位、机关、团体依法应当承担刑事责任危害社会的行为。

双罚制，指单位犯罪中既处罚单位又处罚单位中的个人。两罚制中，直接负责的主管人员和直接责任人员被判处刑罚。这里的刑罚包括自由刑和罚金，主要是自由刑。