公司股权变更程序：

1、公司到工商部门领取公司变更申请的相关表格（包括股东会决议和章程修正案），按要求手工填写或打印相关文件，并加盖公章或股东签字。

2、写好股东的退股支出单和会计凭证。如果是转股，还要写好股东的收款单和会计凭证。如果是老股东，就不进行验资；若转让给新股东，还需将这部分投入资本进行验资。

3、到会计师事务所领取银行询价函。

4、到银行存入投资资金：股东将自己的部分资金带到银行、法定代表人的私人印章、身份证、验资资金、空白信函表格，并根据自己的公司账户。

5、将所有表格带到会计师事务所出具验资报告。

6、所有信息提交工商部门，三天后换取新的营业执照。

办理全资子公司股权变更手续所涉及的问题

（一）根据《企业国有产权转让管理暂行办法》办理国有企业所属的全资子公司股权转让必须进行评估。

（二）关于税赋

1、根据《财政部国家税务总局关于股权转让有关营业税问题的通知》（财税〔2002〕191号）规定，对股权转让不征收营业税。

2、股权转让协议应按产权转移书据按合同金额万分之五缴纳印花税。同一应税凭证两方或两方以上当事人签订并各执一份的，各方都应就所执的一份各自全额贴花。

3、个人股东转让股权应就增值部分按财产转让所得缴纳个人所得税，税率为百分之二十。对申报的计税依据明显偏低（如平价和低价转让等）且无正当理由的，主管税务机关可参照每股净资产或个人股东享有的股权比例所对应的净资产份额核定。

4、企业股权投资转让所得应并入企业的应纳税所得，依法缴纳企业所得税。根据国税函【2010】79号文规定：企业转让股权收入，应于转让协议生效、且完成股权变更手续时，确认收入的实现。转让股权收入扣除为取得该股权所发生的成本后，为股权转让所得。企业在计算股权转让所得时，不得扣除被投资企业未分配利润等股东留存收益中按该项股权所可能分配的金额。企业取得财产（包括各类资产、股权、债权等）转让收入不论是以货币形式、还是非货币形式体现，除另有规定外，均应一次性计入确认收入的年度计算缴纳企业所得税。

《中华人民共和国公司法》第七十一条有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。

股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，其他股东自接到书面通知之日起满三十日未答复的，视为同意转让。其他股东半数以上不同意转让的，不同意的股东应当购买该转让的股权；不购买的，视为同意转让。

经股东同意转让的股权，在同等条件下，其他股东有优先购买权。两个以上股东主张行使优先购买权的，协商确定各自的购买比例；协商不成的，按照转让时各自的出资比例行使优先购买权。

公司章程对股权转让另有规定的，从其规定。