一、土地承包合同纠纷的处理部门

土地纠纷主要分两种，一是土地所有权的纠纷；二是农村承包经营权方面的纠纷。

（一）土地所有权的纠纷，主要是组与组之间，村与村之间，甚至是乡与乡，县与县之间的土地所有权最属问题的纠纷。这类纠纷由纠纷双方上一级的国土部门提出处理意见，同级政府作出处理决定。

（二）农村土地承包纠纷问题有三个主要途径：

一是通过村民小组或村委会进行调解，或由乡镇人民政府、司法所进行调解；纠纷当事人在协商一致的前提下由村委会或乡镇人民政府作出调解书；双方签字认可后生效；

二是由县级农村土地承包仲裁委员会进行仲裁，仲裁程序与打民事官司类同；

三是向地方法院提起民事诉讼。在土地承包纠纷的仲裁或诉讼中，相关法律没有设定前置条件，可以按纠纷当事人的意愿任意选择其中的解决方式。一般顺序是先调解，调解不成再仲裁，对仲裁不服再打官司。

二、土地承包经营权纠纷

农民俞某、屠某是同一村民组农民。俞某自农村实行家庭联产承包责任制时起，就从村集体获得一块0．9亩土地的承包经营权。1998年农村土地二轮承包时，俞某继续承包这块地，并获得了《农村集体土地承包经营权证书》，有效期为30年。1999年，俞某全家外出做生意，将这块承包地交给屠某夫妇代为耕种，并口头约定可随时收回。2004年，俞某回乡后向屠某夫妇索要这块耕地，但屠某夫妇认为自己耕种这块土地多年，土地承包关系早已发生改变，所以拒绝了俞某的要求。无奈之下，俞某将屠某夫妇告上法庭，要求他们立即退还耕地。法院审理后，依法支持了俞某的诉讼请求。

本案中，俞某依法取得了争议土地的承包经营权，因生意繁忙无暇耕种而将承包地临时交给屠某夫妇代为耕种，原、被告之间土地承包经营权的流转属于临时代耕性质，而非经发包方同意后的正式转让，俞某仍是该块土地的承包方，被告屠某夫妇与发包方之间并没有形成新的承包关系。屠某夫妇虽因此取得了该块土地的耕种、收益的权利，但这种权利只是临时的，原告俞某可以随时收回。法院正是基于以上原因，判决支持原告要求返还土地承包经营权的请求的。如果原、被告双方签订了土地承包权转让书面合同，并经发包方，即农村集体经济组织的同意，土地的承包关系就会发生转变，原告也就无权要回承包经营权了。

三、农村土地承包经营纠纷解决方式

（一）和解。和解是指争议双方在没有第三方参与的情况下，自行协商解决纠纷的方式。

（二）调解。调解是指在第三人的主持和疏导下，依据一定的法律规范劝导双方当事人，促使其交换意见，互谅互让，从而解决纠纷的一种方法。

（三）仲裁。仲裁是指双方当事人自愿将他们之间发生的农村土地承包经营纠纷申请仲裁，由农村土地承包仲裁委员会依法按照仲裁程序对农村土地承包经营纠纷作出裁决的活动。

（四）诉讼。诉讼是指人民法院在当事人和其他诉讼参与人的参加下，按照法定的程序和要求，依法解决发生在当事人之间的土地承包经营纠纷的活动。法律依据：《中华人民共和国土地管理法》明确规定“土地承包期延长30年”，超过一般债权法规定的20年最长租赁期限。如果以超过诉讼时效判决驳回登记承包人的诉讼请求，则登记载明的土地承包人与对土地实际占有、使用、收益及享有一定处分权的实际占有人不是同一人，这样土地长期会出现权利与实际的矛盾，而我国尚未建立取得时效制度，这种矛盾会导致土地承包经营权的流转无法进行。