根据我国相关法律规定，征收集体所有的土地，应当依法足额支付土地补偿费、安置补助费、地上附着物和青苗的补偿费等费用，安排被征地农民的社会保障费用，承包地被依法征用的，承包经营权人有权依法获得相应的补偿。

土地承包经营权依法转让后，原承包人即退出承包关系，受让方与发包方形成新的承包关系，土地承包经营权的权利主体发生变更，受让方成为新的土地承包经营权人，有权享有该部分土地补偿费。

一、土地承包经营权的补偿标准

由于土地承包经营权的价值是土地所有权价值的一部分，土地承包经营权的征地补偿标准应当与土地所有权遵循同样的原则，以实现对所有权人和用益物权人的公平保护。目前，我国集体土地所有权补偿采用区片综合价或者年产值标准，今后则由省级政府根据当地土地资源条件、土地产值、土地区位、土地供求关系和社会经济发展水平等综合因素确定。因此，土地承包经营权的征地补偿标准宜由地方政府在综合评估投入成本、运营成本、预期收益等多项要素的基础上，核定土地承包经营权在土地所有权中所占的比重，土地承包经营权人和所有人按核定比例分别受偿，承包人如已获得地上附着物和青苗补偿费，该利益应在核定比例内扣除。按照权重比例方式确立土地承包经营权征地补偿标准，具有便捷、高效等优势，有助于公平保护土地所有权人和承包经营权人的财产权益，也利于维护农村社会的稳定。

二、土地承包经营权的补偿程序

对土地承包经营权进行独立征收补偿，需要有相应的程序规定来保证土地承包经营权人的补偿权利。实施征地时，征地机关应确立土地承包经营权人的受偿主体地位，就征地补偿标准充分听取土地承包经营权人的意见，并告知征地方案及补偿安置方案的具体内容。征地机关与土地承包经营权人达成补偿协议的，解除土地承包合同。土地承包经营权已登记的，登记机关注销登记；未经登记的，发包人与承包人签订解除承包合同协议。征收机关应当在拟被征收的承包地所在的村(组)、乡(镇)公告土地承包经营权征收补偿方案，土地承包经营权人在公告规定时间内，持土地承包经营权证或土地承包经营权合同办理土地承包经营权补偿登记手续。

在土地承包经营权补偿费的支付上，宜采取征地机关直接支付给土地承包经营权人的方式，而不是由农村集体经济组织进行分配或者让农村集体经济组织转交。因为土地承包经营权的征地补偿是国家与承包经营人之间直接的法律关系，农村集体经济组织不是这一法律关系的当事人，无权决定土地补偿费的分配比例，而直接支付补偿费的方式也可以避免出现截留、挪用等侵害土地承包经营权人合法权益的现象。