对补贴的调查和确定，由对外贸易经济合作部（以下简称外经贸部）负责。

对损害的调查和确定，由国家经济贸易委员会（以下简称国家经贸委）负责；其中，涉及农产品的反补贴国内产业损害调查，由国家经贸委会同农业部进行。

外经贸部和国家经贸委，以下统称调查机关。

1．反补贴调查申请

国内产业或者代表国内产业的自然人、法人或者有关组织（以下统称申请人），可以依照《反倾销条例》的规定向外经贸部提出反补贴调查的书面申请。

反补贴调查申请书应当包括下列内容：

第一、申请人的名称、地址及有关情况；

第二、对申请调查的进口产品的完整说明，包括产品名称、所涉及的出口国（地区）或者原产国（地区）、已知的出口经营者或者生产者等；

第三、对国内同类产品生产的数量和价值的说明；

第四、申请调查进口产品的数量和价格对国内产业的影响；

第五、申请人认为需要说明的其他内容。

而且，《反补贴条例》要求反补贴调查申请书应当附具证明下列事项的证据：

第一、申请调查的进口产品存在补贴；

第二、对国内产业的损害；

第三、补贴与损害之间存在因果关系。

2．反补贴调查程序

外经贸部应当自收到申请人提交的申请书及有关证据之日起60天内，对申请是否由国内产业或者代表国内产业提出、申请书内容及所附具的证据等进行审查，经商国家经贸委后，决定立案调查或者不立案调查。在特殊情形下，可以适当延长审查期限。

在决定立案调查前，应当就有关补贴事项向产品可能被调查的国家（地区）政府发出进行磋商的邀请。

在表示支持申请或者反对申请的国内产业中，支持者的产量占支持者和反对者的总产量的50％以上的，应当认定申请是由国内产业或者代表国内产业提出，可以启动反补贴调查；但是，表示支持申请的国内生产者的产量不足国内同类产品总产量的25％的，不得启动反补贴调查。

在特殊情形下，外经贸部没有收到反补贴调查的书面申请，但有充分证据认为存在补贴和损害以及二者之间有因果关系的，经商国家经贸委后，可以决定立案调查。但是，如在《反倾销条例》中的情形一样，这里亦未规定什么是“特殊情形”。

立案调查的决定，由外经贸部予以公告，并通知申请人、已知的出口经营者、进口经营者以及其他有利害关系的组织、个人（以下统称利害关系方）和出口国（地区）政府。

立案调查的决定一经公告，外经贸部应当将申请书文本提供给已知的出口经营者和出口国（地区）政府。

《反补贴条例》规定调查机关可以采用问卷、抽样、听证会、现场核查等方式向利害关系方了解情况，进行调查。调查机关应当为有关利害关系方、利害关系国（地区）政府提供陈述意见和论据的机会。外经贸部认为必要时，可以派出工作人员赴有关国家（地区）进行调查；但是，有关国家（地区）提出异议的除外。

调查机关进行调查时，利害关系方、利害关系国（地区）政府应当如实反映情况，提供有关资料。利害关系方、利害关系国（地区）政府不如实反映情况、提供有关资料的，或者没有在合理时间内提供必要信息的，或者以其他方式严重妨碍调查的，调查机关可以根据可获得的事实作出裁定。

利害关系方、利害关系国（地区）政府认为其提供的资料泄露后将产生严重不利影响的，可以向调查机关申请对该资料按保密资料处理。调查机关认为保密申请有正当理由的，应当对利害关系方、利害关系国（地区）政府提供的资料按保密资料处理，同时要求利害关系方、利害关系国（地区）政府提供一份非保密的该资料概要。按保密资料处理的资料，未经提供资料的利害关系方、利害关系国（地区）政府同意，不得泄露。调查机关应当允许申请人、利害关系方和利害关系国（地区）政府查阅本案有关资料；但是，属于按保密资料处理的除外。

在反补贴调查期间，应当给予产品被调查的国家（地区）政府继续进行磋商的合理机会。磋商不妨碍调查机关根据本条例的规定进行调查，并采取反补贴措施。

外经贸部、国家经贸委根据调查结果，分别就补贴、损害作出初裁决定，并就二者之间的因果关系是否成立作出初裁决定，由外经贸部予以公告。

初裁决定确定补贴、损害以及二者之间的因果关系成立的，外经贸部、国家经贸委应当对补贴及补贴金额、损害及损害程度继续进行调查，并根据调查结果分别作出终裁决定，由外经贸部予以公告。

在作出终裁决定前，应当由外经贸部将终裁决定所依据的基本事实通知所有已知的利害关系方、利害关系国（地区）政府。

反补贴调查，应当自立案调查决定公告之日起12个月内结束；特殊情况下可以延长，但延长期不得超过6个月。

3．反补贴调查的终止

按照《反补贴条例》第28条的规定，有下列情形之一的，反补贴调查应当终止，并由外经贸部予以公告：

第一、申请人撤销申请的；

第二、没有足够证据证明存在补贴、损害或者二者之间有因果关系的；

第三、补贴金额为微量补贴的；

第四、补贴进口产品实际或者潜在的进口量或者损害属于可忽略不计的；

第五、通过与有关国家（地区）政府磋商达成协议，不需要继续进行反补贴调查的；

第六、外经贸部和国家经贸委共同认为不适宜继续进行反补贴调查的。

来自一个或者部分国家（地区）的被调查产品有前款第二、三、四、五项所列情形之一的，针对所涉产品的反补贴调查应当终止。