检察院两次退侦之后，应当作出不起诉决定。根据《刑事诉讼法》的规定，人民检察院在办理审查起诉案件时，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查。补充侦查以二次为限，每次不超过一个月。对于第二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉决定。

一、法律依据

《刑事诉讼法》第一百七十一条：人民检察院审查案件，可以要求公安机关提供法庭审判所必需的证据材料；认为可能存在本法第五十四条规定的以非法方法收集证据情形的，可以要求其对证据收集的合法性作出说明。人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查起诉期限。对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。

《刑事诉讼法》第156条规定：下列案件在本法第一百五十四条规定的期限届满不能侦查终结的，经省、自治区、直辖市人民检察院批准或者决定，可以延长二个月：

(一)交通十分不便的边远地区的重大复杂案件；

(二)重大的犯罪集团案件；

(三)流窜作案的重大复杂案件；

(四)犯罪涉及面广，取证困难的重大复杂案件。

根据法律的规定，检察院可以将认定有错误或者证据不足的诉讼案件退回到公安机关进行重新侦查，在具体的司法实践中，对退侦的次数是有限制的，公安机关必须在规定的次数内完成诉讼案件的侦破，如果不能对犯罪事实进行认定，则需要根据相关规定的要求对犯罪嫌疑人进行释放。

在我国检察院审理案件时，对于案件证据不足或不清楚的，要求公安机关补充证据在1个半月前进行审判。保护这类案件的当事人权益，对这类案件证据进行收集，符合法律的予以公诉办理，不符合的应释放这类人员。

检察机关在审理案件时，相关的审理如存在交通不便、犯罪区域广的、案件情况复杂的，可以申请上级机关，延长这类案件的审查时间。确保当事人的合法权益进行办理，不能证明犯罪的应积极的释放这类人员。