外资股权转让所得税在性质上属于预提所得税，税款应由买方代扣代缴。我国《外资所得税法》第十九条规定：“……依照前款规定缴纳的所得税，以实际受益人为纳税义务人，以支付人为扣缴义务人。税款由支付人在每次支付的款额中扣缴。扣缴义务人每次所扣的税款，应当于五日内缴入国库，并向当地税务机关报送扣缴所得税报告表。”

国家税务总局发布的《国家税务总局关于加强外国企业预提所得税代扣代缴管理工作的通知》规定：“扣缴义务人同外国企业签订信贷、租赁、技术转让、股权转让、担保等合同或协议后，应将所签订的上述合同报主管税务部门；同时应严格按照税法的规定履行扣缴义务。”

《新所得税法》规定，“对非居民企业取得本法第三条第三款规定的所得应缴纳的所得税，实行源泉扣缴，以支付人为扣缴义务人。税款由扣缴义务人在每次支付或者到期应支付时，从支付或者到期应支付的款项中扣除。”

一、外商投资企业股权转让所得税的计算

1、我国关于股权转让所得税问题的解释散见于不同时期的多个法规中，而且解释都不尽相同，并且其中只有部分适用于外资股权转让所得税，因此，实务人员需要系统了解这些法规并且判断其适用性，才能准确地计算出外资股权转让应缴纳的所得税。

财政部规定：“股权转让所得是指合营企业的外国合营者、外资企业的出资者转让其在企业所有的股权而获取的超出其出资额部分的转让收益，应按规定征收20％预提所得税”。这里，股权转让所得是转让价格与出资额之间的差额。转让价格一般理解为收购双方确定的转让价格，出资额应理解为等值人民币金额。

2、转让成本中“收购该项股权时向该股权的原转让人实际支付的股权转让金额”有一个前提条件：只有收购股权时已经缴纳过预提所得税后，向该股权的原转让人实际支付的股权转让金额才可以计为计税转让成本，否则，只能以原转让人的出资成本作为计税转让成本。

基于与国税发同样的避免双重征税原则，《企业改制中若干所得税业务问题的暂行规定》明确规定，计算企业转让股权所得税的转让收益也可以扣除盈余公积和未分配利润等项目，但《国家税务总局关于企业股权投资业务若干所得税问题的通知（一）》否定了这一原则，要求：“企业股权转让所得或损失是指企业因收回、转让或清算处置股权投资的收入减除股权投资成本后的余额。企业股权投资转让所得应并入企业的应纳税所得，依法缴纳企业所得税”。《国家税务总局关于企业股权转让有关所得税问题的补充通知》规定：“股权转让人应分享的被投资方累计未分配利润或累计盈余公积应确认为股权转让所得，不得确认为股息性质的所得”。

3、按照我国税收法规适用性规则，财政部国税发及国税这些文都只适用于内资企业，不适用于外商投资企业。因此，国税发71号文目前仍是关于外资股权转让的最新规定，即，外商投资企业的外方股东转让其股权时，计税转让收益中可以扣除股权转让人享有的盈余公积和未分配利润等留存收益项目，但中方股东转让其股权则不能扣除。

《新所得税法》规定，非居民企业的转让财产所得，以收入全额减除财产净值后的余额为应纳税所得额，其中“收入全额”和“财产净值”的具体含义并不是清晰可见，需要在《新所得税法》的实施细则中加以明确。按字面含义理解，收入全额应该是指股权转让人就转让的股权所收取的包括现金、非货币资产或者权益等形式的金额，财产净值是指财产的账面净值，具体到外商投资企业的外资股权的财产净值应指外资股东应享有的外商投资企业净资产的账面净值。但考虑到外商投资企业经常有资产重组等行为，由此导致外资股东享有的外商投资企业净资产的变化属于资本利得，在资产重组时形成，在股权转让时实现。从所得税税收法理上看，此类资本利得应在外资股权转让时计入应纳税所得额。为避免税款计算遗漏，建议将外资股权转让中的“财产净值”解释为外资股东投入到外商投资企业的资本和应享有外商投资企业盈余公积和未分配利润的数额。