自建房无产证拆迁也是有补偿的，没房产证的房屋征收属于产权不明且需认定房屋是否合法的建筑，这种房屋征收时需要增加两个程序，一是由主张这房屋产权的人提出申请主张对这房屋享有产权，如有虚假负法律责任，然后征收人在征收现场及相关媒体公示60天，没有别人主张这房屋的产权就可以认定产权人，二是，由规划、国土、住建三个部门联合认定该房是否属于违章建筑，如果认定合法建筑，这房屋就可以测量评估计算出补偿金额了。

根据我国相关法律法规的规定，房屋拆迁的程序主要有：

1、调查核实。拆迁人收到征地批文后，首先要到派出所、房管站抄录征地范围内的常住人口，以及全部房产情况，按表格逐一登记，并上门大量核实。

2、逐户走访。拆迁人应成立拆迁小组，对所有的被拆迁人逐户走访，全面进行宣传接触，了解被拆迁人的拆迁安置愿望。

3、编制拆迁计划。根据调查核实的情况以及国家、地方有关拆迁的法律规定，及时编制拆迁计划和拆迁方案，确定拆迁时间、拆迁步骤和拆迁形式。

4、申请拆迁。拆迁人持有关的国家批文、拆迁计划和拆迁方案，向当地拆迁主管部门提出申请。经申查批准并领到拆迁许可证后，方可进行拆迁。

5、发出拆迁公告。拆迁许可证一经批准发放，拆迁主管机关应将拆迁人、拆迁范围、拆迁期限等以公告或其他形式予以公布，同时应作好房屋拆迁的宣传、解释工作。

6、签订协议。在公告规定的时限内，拆迁人与被拆迁人应按国家和本地区关于安置、补偿的有关规定在自愿、有偿的基础上签订协议书。协议应明确补偿办法和数额、安置面积和地点、搬迁过渡方式和时限以及违约责任等。协议经双方同意，可送拆迁主管机关备案和公证机关公证。

7、实施拆迁。被拆迁人搬迁后，拆迁人应及时在批准的拆迁范围和期限内实施拆迁。

一、房屋拆迁补偿安置协议需要注意以下问题：

1、房屋拆迁补偿安置协议是民事合同，只涉及民事问题，如拆迁过程中如何安置被拆迁人、承租人，如何补偿被拆迁人的损失等问题。而能否进行房屋拆迁则属于行政行为，不是房屋拆迁补偿安置协议的内容。

2、房屋拆迁补偿安置协议的当事人具有法定性和特定性。协议的当事人是指拆迁人和被拆迁人，涉及到租赁房拆迁的，承租人也可以成为当事人。

3、房屋拆迁补偿安置协议的主要条款，必须包括以下内容：

(1)补偿方式和补偿金额；

(2)安置用房面积和安置地点；

(3)搬迁期限；

(4)搬迁过渡方式和过渡期限。以上内容属于强制性规范，法规原文中的用语是“应当”而不是“可以”。

4、房屋拆迁协议的签订必须采用书面形式。法律虽未明文规定采用何种形式，但由于房屋拆迁协议约定的内容复杂，且不能即时履行，因此，房屋拆迁协议必须采用书面形式。

5、房屋拆迁补偿安置拆迁协议必须在拆迁公告规定的期限内订立。

6、房屋拆迁补偿安置拆迁协议必须依法签订。