一、办理港澳通行证会查案底吗

所谓港澳通行证，俗称双程证，是由公安部国家移民管理局签发给中国内地居民因私往来香港、澳门地区旅游、探亲、从事商务、培训、就业、留学等非公务活动的旅行证件。根据我国《出入境管理法》规定，对以下几种现行犯的情形是不能批准办理该证件的：

1、被判处刑罚尚未执行完毕或者属于刑事案件被告人、犯罪嫌疑人的；

2、有未了结的民事案件，人民法院决定不准出境的；

3、因妨害国（边）境管理受到刑事处罚或者因非法出境、非法居留、非法就业被其他国家或者地区遣返，未满不准出境规定年限的。

由此可见，在审批办理该证件时，由于需要了解申请办证人是否存在上述禁止情形，显然需要查阅申请人的犯罪记录。因此，办理港澳通行证需要查阅案底，但只有几种情形会依法不予批准，而不是所有的案底对办证都会有影响。

二、怎么办港澳通行证

1、首次申请往来港澳通行证和签注，申请人本人到当地公安分局出入境办证大厅递交申请，不能委托代办。提交申请人身份证、户口簿复印件，交验原件。军人须交验身份证明。申请人浅蓝色底正面半身彩照（规格为48mm×33mm）一张贴在申请表上。属首次或换发港澳通行证的，须提交已与省厅照片检测中心联网的照片回执。

2、签注种类：3个月一次签注、3个月二次签注、1年一次签注、1年二次签注（不管自由行或跟团，每次在香港或澳门逗留不超过7天）

3、办理港澳通行证花费：

往来港澳通行证每证100元；

一次有效签注20元；

二次有效签注40元。

三、案底的含义

案底：一般指某人过去犯法或犯罪行为的记录。又称犯罪人员犯罪记录制度，在我国法律中一般指有过刑事犯罪前科的档案记录，而该犯罪档案一般存放至公安部门保存。

办理港澳通行证的法律依据：

《中华人民共和国出境入境管理法》第十条

中国公民往来内地与香港特别行政区、澳门特别行政区，中国公民往来大陆与台湾地区，应当依法申请办理通行证件，并遵守本法有关规定。具体管理办法由国务院规定。

《中华人民共和国出境入境管理法》第十二条

中国公民有下列情形之一的，不准出境：

1、未持有效出境入境证件或者拒绝、逃避接受边防检查的；

2、被判处刑罚尚未执行完毕或者属于刑事案件被告人、犯罪嫌疑人的；

3、有未了结的民事案件，人民法院决定不准出境的；

4、因妨害国（边）境管理受到刑事处罚或者因非法出境、非法居留、非法就业被其他国家或者地区遣返，未满不准出境规定年限的；

5、可能危害国家安全和利益，国务院有关主管部门决定不准出境的；

6、法律、行政法规规定不准出境的其他情形。