1、主体不同，审查批捕的主体是人民检察院的侦监科，审查起诉的主体是是由人民检察院公诉科。

2、在案件中所处的阶段不同。审查批捕是侦查机关(一般为公安机关)在立案侦查后，对案件的基本事实有了一定的了解，认为犯罪嫌疑人符合逮捕的条件与有逮捕的必要的，就会把案件移送到检察院侦监科申请逮捕犯罪嫌疑人，经检察院侦监科审查批捕后再移送回侦查机关继续侦查;审查起诉是侦查机关对案件侦查终结后移送到检察院公诉科请公诉科提起公诉，检察院公诉科就对这些案卷进行审查。

3、后果不同。案件经检察院侦监科审查批捕后，后果有两个，就是批准逮捕犯罪嫌疑人或者不予批准逮捕犯罪嫌疑人，案卷会移送回侦查机关继续侦查;案件经过检察院公诉科审查终结后，后果也有两个，起诉或者不起诉，如果是符合起诉条件的案件，经过审查终结后，就会被移送到人民法院提起公诉。

一、不批捕会起诉吗

一般不批捕后，不一定不起诉，要根据案件的具体情况而定：

1、逮捕一般是适用于严重犯罪的情况，只能适用于可能判处坐牢以上刑罚的犯罪嫌疑人；

2、不批准逮捕只是有可能不起诉，也有可能是犯罪情节较轻。

检察院批捕后的程序如下：

1、对犯罪嫌疑人逮捕后的侦查羁押期限不得超过二个月。案情复杂、期限届满不能终结的案件，可以经上一级人民检察院批准延长一个月；

2、公安机关侦查终结的案件，应当做到犯罪事实清楚，证据确实、充分，并且写出起诉意见书，连同案卷材料、证据一并移送同级人民检察院审查决定；

3、人民检察院对于公安机关移送起诉的案件，应当在一个月以内作出决定，重大、复杂的案件，可以延长半个月；

4、人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。 对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查起诉期限；

5、人民检察院认为犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，应当作出起诉决定，按照审判管辖的规定，向人民法院提起公诉；

6、人民法院审理公诉案件，应当在受理后一个月以内宣判，至迟不得超过一个半月。

二、诈骗罪起诉流程和时间是怎么安排的

按照《刑事诉讼法》的规定，一般刑事案件大致要经过3个阶段，即侦查阶段(公安机关)、审查起诉阶段(人民检察院)和审判阶段(人民法院)。

1、公安机关立案侦查，对犯罪嫌疑人刑事拘留或者逮捕以后，侦查阶段一般是两个月。

2、检察院审查起诉，审查起诉阶段一般是一个月时间。

3、法院审判，检察院向法院提起公诉，法院审判阶段，一般是两个月。