宝宝合作医疗缴费方式如下：

1、首先要在孩子出生的医院办理出生证明，然后携带孩子的出生证明以及身份证等材料到居住地所在派出所，为孩子办理户口本或添加户口；

2、然后新生儿社保首次缴费需要到当地行政服务大厅社保处缴纳当年费用，社保局工作人员会给开具缴费证明；

3、携带缴费证明及孩子的户口本，一张白底一寸照片到当地银行，填表申请办理医保卡；

4、由于社保卡制作时间较长，如果临时急用，可以先到行政服务大厅社保卡经办信息中心领取临时医保卡，时效三个月，到期可以再去更换。

合作医疗报销流程如下：

1、准备就医医院出具的出院小结、发票、用药明细表；

2、本人身份证、医保卡、单位出具的就医证明（需盖公司公章），如不是企业参保则不需单位出具的就医证明；

3、带上以上资料到当地医保处即可办理。

法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第二十九条

参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。

社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。

第七条

国务院社会保险行政部门负责全国的社会保险管理工作，国务院其他有关部门在各自的职责范围内负责有关的社会保险工作。

县级以上地方人民政府社会保险行政部门负责本行政区域的社会保险管理工作，县级以上地方人民政府其他有关部门在各自的职责范围内负责有关的社会保险工作。

医保合作医疗有什么区别

医保合作医疗有以下区别：

1、二者所覆盖的对象不同：

农村合作医疗保险：只有农村户口的人才能够办理农村合作医疗保险，其他非农户口不能办理；

职工医保：城镇所有用人单位及其职工都要参加，用人单位包括企业：国有企业、集体企业、外商投资企业、私营企业等；用人单位另外还包括机关、失业单位、社会团体、民办非企业单位。

2、二者缴费主体不同：

农村合作医疗保险：缴费主体是农民个人、集体和政府，通过三方面筹资来保障这份保险能够为农民百姓提供医疗保障；

职工医保：缴费主体是劳动者和用人单位，通过这两方面筹资来保障这份保险能够为劳动者提供医疗保障；

3、二者缴费方式不同：

农村合作医疗保险：农民自愿参加即可，没有强制性，需要这份保险保障就参加，不需要即可不参加，只是要参加的话必须以家庭为单位整户参加，而且每年都要办理参保缴费手续，并不是参保一次之后只要缴费就可以。

职工医保：对于用人单位来说，它具有强制性，就是用人单位必须要为自己的员工办理职工医保，而且缴纳的话，要达到一定的年限才可以，不过只要第一次参保了之后，以后的费用都会通过工资直接扣除，由单位和个人共同承担支付。

4、二者报销比例不同：

农村合作医疗保险：参保者没有个人账户，报销比例相对于职工医保来说要低一些，限额较低，因为是一年一参合，参合本年度享受报销；

职工医保：参保者拥有个人账户，定期都会有费用划入到个人账户里，而且报销比例比较高，虽然说有起付标准，但是它的报销最高限额比较高，医疗费也不封顶。只要参保人员完成了规定的缴费年限后，就可以享受到终身医疗保险待遇。

5、二者缴费标准不同：

农村合作医疗保险：它的缴费标准有好几种情况，分为100元、200元、300元、400元、500元不等，每个地方都有各自的缴费标准，需要结合当地的缴费标准来选择。

职工医保：它的缴费标准与参保者的工资有关，按照相关规定的比例标准进行缴纳，一般来说，个人需要承担20％，单位需要承担80％，单位要缴的多，职工医保缴费标准要比农村合作医疗保险高。

法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第二十三条

职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。

无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。