随着审计技术的发展，一些新方法得到使用，新审计准则对审计方法进行了新的归纳，列举了八大类方法：检查记录或文件、检查有形资产、观察、询问、函证、重新计算、重新执行、分析程序。较之以前的方法内涵更加丰富，描述更加准确。其中几类审计方法对资源审计来说仍是必须和有效的。

1、检查记录和文件。这是最传统的审计方法，在对资源开发利用、环境治理保护资金的筹集、管理、使用，特别是资金的流向审计，以及资源环境保护法规、制度的建立、健全性审计，还是有关资源环境开发、保护的决策情况审计，必须采用这种方法对有关账册、法规、文件、纪录进行查阅。

2、检查有形资产。它与原来的“监盘”有着不同的内涵，它不仅要检查实物资产的数量，更要检查其存在状态。资源环境审计中，检查有形资产主要是检查用于开发、保护资源环境的各种设施、设备数量上是否满足要求、运转是否良好。

3、观察。就是现场观察资源环境状况是否良好，采取的有关措施、手段是否产生了效果，以及被审计单位从事资源环境工作的人员的业务活动或执行的程序是否符合相关规定。

4、询问。资源环境审计中应特别重视这一方法，主要采取调查问卷和座谈询问的方式。比如对环境保护情况的调查，向长期生活在该区域内的有关人员进行问卷或座谈了解，结果可能更真实、真切。

5、重新执行。资源环境审计中，这一方法有重要作用，就是将有关资源环境保护的方法、措施，由审计人员(专业人员)再执行，对结果进行再检验。比如在对水环境质量进行审计中，不能只依赖环保部门提供的数据，应由审计人员现场取样后，在第三方重新执行检测程序，以查证水体质量。

6、分析程序。信息技术已在资源环境领域普遍使用，有关部门的业务数据库都能提供资金结算、能源消费、环保统计、在线监测等数据，审计人员可以研究各种数据之间，特别是财务数据与非财务数据之间的内在关系，进而对资源环境开发和保护情况作出评价。这一方法还包括调查识别出的、与其他相关信息不一致或与预期数据严重偏离的波动和关系。