不合法。在没有取得相关部门审批的情况下，进行征收拆迁房屋是违法的行为，被征收人有权拒绝征收。当事人的土地即使被国务院作出的征地批复全部征收，市政府和国土局的先占地后取得征地手续，先发放补偿费后取得征收土地方案，都违反了程序的规定。

如果存在不合法拆迁的，可以先向相关部门申请政府信息公开，如果政府信息公开表明没有征地批准文件，可以向国土资源部门提出土地违法查处申请，请求国土资源部门对地方政府的违法征地或相关企业的违法占地行为进行查处。

征地拆迁程序是

1、拆迁人取得征地以及规划等批准文件，然后经申请由区县建委发布暂停办理相关手续公告；

2、拆迁人拟定、报批、公布拆迁实施方案；

3、拆迁人向区县建委申请核发房屋拆迁许可证；

4、区县建委审核发证，并发布拆迁公告；

5、拆迁人与被拆迁人达成拆迁补偿安置协议。

根据《土地管理法》第四十七条，征收土地的，按照被征收土地的原用途给予补偿。征收耕地的补偿费用包括土地补偿费、安置补助费以及地上附着物和青苗的补偿费。

《土地管理法》第四十八条，征收土地应当给予公平、合理的补偿，保障被征地农民原有生活水平不降低、长远生计有保障。

征收土地应当依法及时足额支付土地补偿费、安置补助费以及农村村民住宅、其他地上附着物和青苗等的补偿费用，并安排被征地农民的社会保障费用。

征收农用地的土地补偿费、安置补助费标准由省、自治区、直辖市通过制定公布区片综合地价确定。制定区片综合地价应当综合考虑土地原用途、土地资源条件、土地产值、土地区位、土地供求关系、人口以及经济社会发展水平等因素，并至少每三年调整或者重新公布一次。

征收农用地以外的其他土地、地上附着物和青苗等的补偿标准，由省、自治区、直辖市制定。对其中的农村村民住宅，应当按照先补偿后搬迁、居住条件有改善的原则，尊重农村村民意愿，采取重新安排宅基地建房、提供安置房或者货币补偿等方式给予公平、合理的补偿，并对因征收造成的搬迁、临时安置等费用予以补偿，保障农村村民居住的权利和合法的住房财产权益。

县级以上地方人民政府应当将被征地农民纳入相应的养老等社会保障体系。被征地农民的社会保障费用主要用于符合条件的被征地农民的养老保险等社会保险缴费补贴。被征地农民社会保障费用的筹集、管理和使用办法，由省、自治区、直辖市制定。