（一）公诉案件和自诉案件的来源不同，公诉案件是由国家公诉机关提起的，自诉案件是由被侵害人、代理人或者其亲属提起的;

（二）公诉案件的犯罪性质相对比较严重，而且对社会造成的危害性也比较大，而且公诉案件一经审判就难以对人们法院作出的判决进行撤诉，如果法院允许撤诉则需要查清事实再重新作出判决;而自诉的案件犯罪性质就没有那么严重，而且原告可以选择与被告人进行和解或者撤诉，如果案件不是很严重的，法院先进行调解。

（三）自诉案件中被告人可以提出反诉，但是公诉案件的被告人虽然有权利提出控告但觉对不能反诉。

一、法院调解能不能判刑

要看案件是公诉案件还是自诉案件。如果说程度是很严重的那种的话，构成了刑事犯罪，即使调解了也不会免于处罚。公诉案件，因为是检察院提起的公诉，而且检察院一般不会申请撤诉，所以轻伤案件在法院调解成功后仍会判刑，不过一般都是适用缓刑。自诉案件，因为自诉人可以申请撤诉，调解成功后可以由自诉人申请撤诉，法院一般会裁定允许撤诉，这个就不用判刑了。

二、《刑事诉讼法》的法律规定

第一百八十一条人民法院对提起公诉的案件进行审查后，对于起诉书中有明确的指控犯罪事实的，应当决定开庭审判。

第二百零五条人民法院对于自诉案件进行审查后，按照下列情形分别处理：

（一）犯罪事实清楚，有足够证据的案件，应当开庭审判；

（二）缺乏罪证的自诉案件，如果自诉人提不出补充证据，应当说服自诉人撤回自诉，或者裁定驳回。

自诉人经两次依法传唤，无正当理由拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，按撤诉处理。

法庭审理过程中，审判人员对证据有疑问，需要调查核实的，适用本法第一百九十一条的规定。

第二百零六条人民法院对自诉案件，可以进行调解；自诉人在宣告判决前，可以同被告人自行和解或者撤回自诉。本法第二百零四条第三项规定的案件不适用调解。

第二百零八条基层人民法院管辖的案件，符合下列条件的，可以适用简易程序审判：

（一）案件事实清楚、证据充分的；

（二）被告人承认自己所犯罪行，对指控的犯罪事实没有异议的；

（三）被告人对适用简易程序没有异议的。

人民检察院在提起公诉的时候，可以建议人民法院适用简易程序。