政府征收土地闲置三年的处理方式是：可以主张恢复耕种，连续二年未使用的，经原批准机关批准，由县级以上人民政府无偿收回用地单位的土地使用权；该幅土地原为农民集体所有的，应当交由原农村集体经济组织恢复耕种。

一、农村宅基地怎么分配

农村宅基地的分配是按户来分配的。

1、一户一宅，一户人家只能拥有一处宅基地，多余的要归还村集体；

2、宅基地是农村的农户或个人用作住宅基地而占有、利用本集体所有的土地，宅基地遗产分配按照法定顺序继承分配。

宅基地使用权的变动如下：

1、宅基地转让、出租的，不得再申请宅基地；

权利人转让房屋及其宅基地使用权的，应当将房屋及宅基地使用权转让给本集体经济组织内符合建房申请宅基地条件的成员；

2、转让房屋及宅基地使用权后，宅基地使用权主体发生变化，并涉及受让人取得新的宅基地，故应当依法办理转让登记手续。宅基地以及住宅房屋，不仅可以用于居住，也可以用于从事家庭生产和经营活动。

3、宅基地使用权的取得具有无偿性、福利性，申请取得宅基地使用权后，依据《确定土地所有权和使用权的若干规定》，空闲或房屋坍塌、拆除两年以上未恢复使用的宅基地，不确定土地使用权。已经确定使用权的，由集体报经县级人民政府批准，注销其土地登记，土地由集体收回。

二、农村房没有土地使用证有前提条件吗

农村房一般会有宅基地使用证。宅基地使用权证，也属于土地使用证。

根据《土地管理法实施条例》第四条第二款、第三款的规定，农民集体所有的土地依法用于非农业建设的，由土地使用者向土地所在地的县级人民政府土地行政主管部门提出土地登记申请，由县级人民政府登记造册，核发集体土地使用权证书，确认建设用地使用权。

设区的市人民政府可以对市辖区内农民集体所有的土地实行统一登记。

三、民法典宅基地翻盖产权归谁

宅基地翻盖后其地上的产权归建设用地使用权人，但是宅基地仍然属于农民集体所有。《土地管理法》第九条规定：城市市区的土地属于国家所有。农村和城市郊区的土地，除由法律规定属于国家所有的以外，属于农民集体所有;宅基地和自留地、自留山，属于农民集体所有。翻建新房所在宅基地的使用权并没有发生变化。《土地管理法》第六十二条：农村村民一户只能拥有一处宅基地，农村村民住宅用地，经乡（镇）人民政府审核，由县级人民政府批准。也就是说，只有经过行政确定程序，才发生宅基地使用权确立的效力。