股东补偿款的分配，应依照《公司法》和《最高人民法院关于适用《中华人民共和国公司法》若干问题的规定（四）》等法律法规来规范。即按照公司章程关于处分公司不动产所得的规定处理，首先看股东有无利润分配的约定，有利润分配约定的，按约定分配利润；无约定的，按照股东实缴的出资比例分配利润。

一、公司盈余分配权发生纠纷应怎么解决

公司盈余分配权发生纠纷解决如下：

1、公司形成具体分配方案的股东大会或者股东大会的有效决议，且有效决议为可执行决议的，股东可以直接按照决议起诉。人民法院应当根据原告的诉讼请求和具体分配方案规定的比例或者金额，及时判决公司分配利润；

2、股东大会或者股东大会未作出具体分配方案的有效决议的，原告提起公司盈余分配纠纷诉讼时，应当提供证据，证据证明公司违反法律规定滥用股东权利，导致公司未分配利润，给其他股东造成损失。

公司盈余分配纠纷是指股东与公司就公司利润分配引起的纠纷。股东利润分配请求权是指股东根据其股东地位和资格向自己分配利润的权利。

二、股东怎么分配利润

股东分配利润的原则是按照实收出资比例。全体股东通过出资协议、公司章程或者其他方式约定不按出资比例分配红利的，该协议具有法律效力，不按照各股东的出资比例分配红利。股份有限公司股东原则上按其持有的股份比例分配红利。但股东可以通过公司章程规定不按持股比例分配红利。股份公司章程规定红利分配方式的，按照规定分配。

三、股东到期未实缴出资

根据《中华人民共和国公司法》规定，公司股东出资不足的，应该承担以下责任：

出资不足股东要承担违约责任。

《中华人民共和国公司法》第二十八条规定，股东不按约缴纳出资的应当向已按期足额缴纳出资的股东承担违约责任。

出资不足股东要对公司承担补缴出资额的责任。

(1)股东以货币(现金)出资的，应当按期足额缴纳公司章程中规定的各自所认缴的出资额，出资不足，应当及时向公司足额缴纳。

(2)股东以非货币财产出资的，当非货币财产的实际价额显著低于公司章程所定价额的，股东应该补足其差额。

出资不足股东的相关股东权利应受到限制。公司法规定，股东出资不足，股东按照实缴的出资行驶股东权利。例如《中华人民共和国公司法》第三十五条规定，股东按照实缴的出资比例分取红利，公司章程另有规定除外。