员工加班有时间限制。根据《劳动法》的相关规定，用人单位只有在生产经营确有需要的情况下，可适当延长工作时间，即加班。且需与工会和劳动者协商。加班的时间上，一般每日不超过一个小时；因特殊原因需延长的，在保障劳动者身体健康的条件下每日不超过三个小时，且每月不超过三十六个小时。双休日加班的时间，也包括在计算36个小时之内。即使单位安排调休，双休日加班的时间也计算在上述36小时之内。

一、员工加班时间限制的例外情形

有下列情况之一的，加班时间不受上述时间的限制：

(1)发生自然灾害、事故或者因其他原因，威胁劳动者生命健康和财产安全，需要紧急处理的；

(2)生产设备、交通运输线路、公共设施发生故障，影响生产和公众利益，必须及时抢修的；

(3)法律、行政法规规定的其他情形。

二、由谁来证明加班时间

劳动者起诉追偿加班费，在存在加班事实的情况下，必然涉及加班时间的确定。如果用人单位与劳动者对加班时间没有争议，自然不存在加班时间的举证责任分配。但因实践中加班时间的复杂性，用人单位与劳动者经常对加班时间存在争议，既然有争议，就必然会存在加班时间的举证责任分配。现在很多用人单位都实行打卡制度，考勤中的打卡时间，仅仅只能初步证明劳动者那段时间一直呆在单位，也就是在单位停留的时间，但这个时间是否全部属于加班时间，还是有部分属于加班时间，有部分属于劳动者在单位私自逗留时间，这就涉及双方的证明责任。

《劳动合同法》第三十一条规定“用人单位应当严格执行劳动定额标准，不得强迫或者变相强迫劳动者加班。用人单位安排加班的，应当按照国家有关规定向劳动者支付加班费”。从该条规定我们可以看出，用人单位安排加班的，应当按照国家有关规定向劳动者支付加班费。也就是说，只有用人单位安排加班的，用人单位才需要支付加班费。因此，对于是否需要加班的，劳动者就应该要对是用人单位安排加班承担举证责任。如果用人单位没有安排加班，劳动者主动要求加班或者自行私自安排加班的，用人单位可以不支付加班费。当劳动者提供了证据证明了单位安排了加班，并有相关考勤记录的，应当认定考勤记录的时间为劳动者的加班时间。如果用人单位否认劳动者考勤记录上的时间只有部分是加班时间的，对于具体加班的时间确定，就应该由用人单位来承担举证责任。