1、销毁会计凭证罪的立案标准是：故意销毁依法应当保存的会计凭证，涉及金额在五十万元以上的;依法应当向司法机关、行政机关、有关主管部门等提供而故意销毁会计凭证的;其他情节严重的情形。

2、法律依据：《最高人民检察院公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定(二)》

第八条隐匿或者故意销毁依法应当保存的会计凭证、会计账簿、财务会计报告，涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉：

(一)隐匿、故意销毁的会计凭证、会计账簿、财务会计报告涉及金额在五十万元以上的;

(二)依法应当向司法机关、行政机关、有关主管部门等提供而隐匿、故意销毁或者拒不交出会计凭证、会计账簿、财务会计报告的;

(三)其他情节严重的情形。

一、隐匿会计账簿不构成犯罪怎么处罚

1、隐匿或者故意销毁依法应当保存的会计凭证、会计帐簿、财务会计报告，构成犯罪的，依法追究刑事责任。

2、有前款行为，尚不构成犯罪的，由县级以上人民政府财政部门予以通报，可以对单位并处五千元以上十万元以下的罚款；对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，可以处三千元以上五万元以下的罚款；属于国家工作人员的，还应当由其所在单位或者有关单位依法给予撤职直至开除的行政处分；对其中的会计人员，并由县级以上人民政府财政部门吊销会计从业资格证书。

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授意、指使、强令会计机构、会计人员及其他人员伪造、变造会计凭证、会计帐簿，编制虚假财务会计报告或者隐匿、故意销毁依法应当保存的会计凭证、会计帐簿、财务会计报告，构成犯罪的，依法追究刑事责任；尚不构成犯罪的，可以处五千元以上五万元以下的罚款；属于国家工作人员的，还应当由其所在单位或者有关单位依法给予降级、撤职、开除的行政处分。

4、对隐匿会计账簿罪的判刑标准也不能一概而论，隐匿会计账簿涉案金额在五十万元以上的才构成犯罪，若不构成犯，当地县以上人民政府的财政部门可以对企业进行行政处罚。新刑法隐匿会计账簿罪的判处是：处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处二万元以上二十万元以下罚金。

二、中国刑法故意销毁会计凭证罪怎么立案

故意销毁会计凭证罪的立案情形有：

1、故意销毁的会计凭证涉及金额在五十万元以上的；

2、依法应当向司法机关、行政机关、有关主管部门等提供而故意销毁或者拒不交出会计凭证的。

《最高人民检察院公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（二）》第八条第一项规定，隐匿或者故意销毁依法应当保存的会计凭证、会计账簿、财务会计报告，涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉：

（一）隐匿、故意销毁的会计凭证、会计账簿、财务会计报告涉及金额在五十万元以上的；

（二）依法应当向司法机关、行政机关、有关主管部门等提供而隐匿、故意销毁或者拒不交出会计凭证、会计账簿、财务会计报告的；

（三）其他情节严重的情形。