同房分居一般是不算分居的。根据相关规定，分居是指夫妻双方在继续维持其夫妻关系的情况下，停止共同生活，并各自建立属于自己的生活方式的状况，不共同居住；同房分居的不属于分居。且因感情不和分居满二年，一方起诉离婚的，法院应进行调解，调解无效，确认感情破裂的，应准予离婚。

二、分居如何认定

1、必须是因感情不和而分居；

夫妻分居，有客观原因造成的、感情不和造成的、以及双方自愿协议分居的等多种情况。比如，夫妻分别在两地工作，因相隔遥远而没有同居条件。这种夫妻分居，并不是因感情不和而造成的，即使分居的时间再长，也不符合“因感情不和而分居”的法定应准予离婚的情形。

有些夫妻，他们感情尚好，也不愿离婚，但由于某种原因，自愿实行分居。这种情况，也不符合“因感情不和而分居”的法定应准予离婚的条件。

作为应准予离婚的法定情形的分居，必须是因夫妻感情出现问题，感情不和、感情破裂、相互厌恶而造成的分居。

2、分居必须是连续的，且已满两年；

首先，从夫妻实际分居的第二日算起，到向法院立案提起离婚诉讼时为止，时间必须满两年。

其次，分居必须是持续的，分居时间必须连续计算。如果分居后又同居，则应从同居后又分居的次日重新计算。不能把前后几次分居的时间累加计算。

3、夫妻分居的实质是互不履行夫妻性生活之义务；

对于夫妻因感情不和而“分居”的理解，不能只简单的理解为分开居住。有些夫妻因家庭住房条件所限，并非感情不和也在分别居住。但是，这种分居并不排除夫妻之间的性生活。他们可以利用种种办法，来满足夫妻之间的相互需要。所以，作为法定应准予离婚的夫妻分居的实质，在于夫妻因感情不和而互不履行夫妻性生活之义务，并持续长达两年。

4、“夫妻分居满两年”须以证据证明。

夫妻分居的原因有很多，但不一定都属于分居离婚的条件之一。而分居也不会必然导致夫妻离婚，此时如果是通过诉讼方式解除婚姻关系的话，要求是因为双方感情不和而分居，之后在分居时间上面至少要持续两年，当然这期间内彼此也没有履行夫妻义务。如若不然，就无法在诉讼离婚中以分居方式离婚。