日前，国家税务总局发布了《关于调整增值税扣税凭证抵扣期限有关问题的通知》（国税函［2009］617号）（下称《通知》），将增值税专用发票、公路内河货物运输业统一发票、机动车销售统一发票（下称“三票”）和海关进口增值税专用缴款书（下称“一书”）等扣税凭证的抵扣期限延长到开具之日起180日内，并就与此相关的一些问题进行了明确。

根据《通知》，以下政策要点需要纳税人准确把握：

一是延长了三票一书的抵扣期限。《通知》规定，增值税一般纳税人取得2010年1月1日以后开具的三票，应在开具之日起180日内办理认证，并在认证通过的次月申报抵扣；实行先比对后抵扣管理办法的一般纳税人，应在一书开具之日起180日内报送《海关完税凭证抵扣清单》申请稽核比对；未实行此管理办法的，应在开具之日起180日后的第一个纳税申报期结束以前，申报抵扣。

二是强调了对三票一书抵扣超时的税务处理。《通知》规定，增值税一般纳税人取得2010年1月1日以后开具三票一书，未在规定期限内按照上述规定办理的，不得作为合法的增值税扣税凭证，不得计算进项税额抵扣。在已明确增值税抵扣凭证的抵扣期限已延长至180日的前提下，《通知》进一步强调，如果纳税人未按照规定要求的期限办理增值税抵扣凭证的认证申报等抵扣事宜，则相应的进项税款不能抵扣，而应计入企业的成本费用，所造成增值税税收负担的增加将由企业自行负担。

三是再次明确了对部分抵扣凭证丢失的处理方法。《通知》规定，增值税一般纳税人丢失已开具的增值税专用发票，应在开具之日起180日期限内，按照《国家税务总局关于修订增值税专用发票使用规定的通知》（国税发［2006］156号）第二十八条及相关规定办理；丢失一书的，应在开具之日起180日期限内，凭报关地海关出具的相关已完税证明，经主管税务机关将一书电子数据审核并纳入稽核系统进行比对无误后，方可允许抵扣。

在虚开增值税专用发票过程中虚开可用于抵扣税款发票用作进项抵扣时的几个问题

犯罪分子在向他人虚开销项增值税专用发票以后，为了掩盖自己虚开的犯罪事实，他们想方设法取得进项增值税专用发票作虚假抵扣，为其继续实施犯罪作掩护。他们一般通过低价购买增值税专用发票的方式获得进项发票用于抵扣，但这样做往往会增加他们的成本，与他们铤而走险牟取暴利的初衷相去甚远。2001年4月29日财政部和国家税务总局颁布了《关于废旧物资回收经营业务有关增值税政策的通知》，规定：自2001年5月1日起，对废旧物资回收经营单位销售其收购的废旧物资免征增值税；生产企业增值税一般纳税人购入废旧物资回收经营单位销售的废旧物资，可按照废旧物资回收经营单位开具的由税务机关监制的普通发票上注明的金额，按10％计算抵扣进项税额。这项国家对废旧物资回收经营单位税收优惠政策一出台，犯罪分子便开始动了歪脑筋，他们虚假出资成立废旧物资回收公司，利用废旧公司收购废旧物资免缴增值税、向他人出售时开具的普通发票还可抵扣10％进项税的优惠政策，从废旧公司向自己的其他公司虚假开具普通发票作为进项抵扣，从而形成了一条虚开增值税发票的＂生产线＂，从源头上解决了犯罪分子对外虚开的＂后顾之忧＂。因此，在实践中，虚开增值税专用发票犯罪往往和虚开用于抵扣税款发票犯罪纠合在一起，发生两罪竞合的情况，使得这类案件更加复杂化，由此即出现了在此情况下如何适用法律的一系列问题。