农村宅基地纠纷调解的程序的进行如下：双方当事人共同向县级以上人民政府土地管理部门提出书面申请，同时出示举证的材料和依据；工作人员进行现场调查并组织双方当事人进行调解，制作书面调解书；调解未达成一致的可以根据纠纷内容直接向人民法院提起诉讼。

一、土地确权证发下来了，有纠纷怎么办

建议双方当事人先通过协商自行解决争议，如果争议各方达成一致意见则协商成功，如果协商不成或者协商达成了协议而另一方又反悔，不履行协议，他方可以依照本条的规定提请乡（镇）人民政府等调解解决，人民政府收到争议案件后，一般是对当事人先进行调解，调解不成的进行行政裁决。其中人民政府的调解是依据事实和法律对当事人进行调停，促使争议各方当事人进行和解。如果调解不成或者当事人不愿意进行调解，人民政府则依法进行裁决。一般来讲，具体工作由土地行政主管部门承办，但作出处理决定须以人民政府的名义并出具处理决定书。该决定书须加盖人民政府处理土地所有权和使用权争议的专用章。当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。

一般而言，村土地确权有纠纷时，政府有具体的处理流程为：

（1）向县级以上人民政府土地管理部门或者乡级人民政府提出书面申请;

（2）双方当事人出示举证的材料和依据;

（3）工作人员现场调查材料和取证;

（4）组织双方当事人进行调解，制作书面调解书;

（5）调解未达成协议的，或者调节书送达前一方或者双方反悔的，土地管理部门及时提出处理意见，报人民政府错处处理决定。

二、土地确权证丢了去哪里补办

农村土地确权登记后，所颁发的土地承包经营权证书遗失的，可以向农业委员会申请补办。属于原来颁发的土地承包经营权证书丢失的，则不需要补办，可以直接申请重新确权登记。

一、农村土地使用权证补办的流程如下：

1、申请。由农村村民个人向所属乡镇国土资源管理所提出申请，领取土地登记申请审批表；提交个人身份证或农村居民户口簿复印件一份；

2、调查。由乡镇国土资源管理所对申请者的用地进行地籍调查、地籍测量、申请人现场指界、邻宗地签字盖章，填写地籍调查表，绘制宗地草图；

3、审核。先由乡镇国土资源管理所进行审核，再报县国土资源局审核，审核用地材料是否合法，用地界线是否无争议，用地面积是否准确；

4、审批。经审核符合“用地面积清楚，界址准确，权属合法，无争议”原则的，可批准并进行张榜公布，在公布一个月内无单位或个人对其提出争议的，由县人民政府颁发集体土地使用证。

二、农村土地使用权争议的处理方式如下：

1、协商解决。即由发生争议的双方当事人在平等自愿的基础上，就争议双当事人在平等自愿的基础上，就争议的土地进行协商，取得一致意见的，签定书面协议，并送当地人民政府土地行政主管部门备案；

2、调解解决。双方当事人协商不成时，当事人一方或双方可以向当地政府土地行政主管部门提出处理申请。土地行政主管部门接到申请后，先进行调解。调解达成协议的，制作调解书，经双方当事人签名或盖章，调解人员署名并加盖调解机关的印章；

3、政府处理解决。当调解未达成协议，或者经调解达成协议，但在调解书送达前，一方或者双方当事人反悔的，土地行政主管部门应及时提出处理意见，报人民政府作出处理决定；

4、行政复议解决。政府对土地权属争议的处理决定在性质上属于土地确权行为，即属于政府的一种具体的行政行为，所以，如果当事人对政府的处理决定不服，可以依法申请行政复议，通过复议方式解决争议；

5、行政诉讼解决。如果当事人对有关复议机关的复议决定不服，还可以向人民法院提起诉讼，通过诉讼方式解决争议。由于行政复议不是行政诉讼的必经程序，所以，当事人如果对政府的处理决定不服，也可以不经行政复议程序，直接向人民法院起诉。

综上所述，作为农户家庭土地承包经营权共有人进行确权登记，准备相关证明材料向当地土地管理部门进行反映。对于漏登、错登的农户进行土地确权，先到村登记，然后由乡镇进行汇总，待县确权办查明情况后，根据具体情况，对符合确权条件的，县确权办将统一安排时间，进行补登。

三、邻居宅基地纠纷怎么办

1、向县级以上人民政府土地管理部门或者乡级人民政府提出书面申请、双方当事人出示举证的材料和依据、工作人员现场调查材料和取证4、组织双方当事人进行调解，制作书面调解书5、调解未达成协议的，或者调节书送达前一方或者双方反悔的，土地管理部门及时提出处理意见，报人民政府错处处理决定。