如果施工合同备案超过了时限的话是会有处罚的，一般都是进行民事处罚的，不会有刑事处罚。施工合同约定工期时，如果超出了合同工期，需要分不同的原因进行讨论，如果是发包方的原因，比如发包方场地协调出现问题，导致施工方迟迟不能进场施工，或者发包方提供施工材料，但材料却迟迟无法进场的，那么在这种情况下，一般都由发包方承担延期责任。

如果是因为施工方的原因，比如设备、人员不到位，施工人员拖延严重等原因，导致超过工期的，则由施工方负责。

一、工程质量问题责任认定包括哪几种情况

工程质量问题责任认定有以下几种情况:(一)工程质量责任由承包方承担的一般原则工程质量出现问题就建设方与承包方及建筑施工方而言，其责任一般由承包方承担。(二)工程质量责任由发包方承担的例外情况(三)工程质量责任推定由发包方承担的特定情况工程质量出现问题就建设方与承包方及建筑施工方而言，其责任一般由承包方承担。

二、施工可以顺延工期情况

1、发包人未按合同约定时间开工的，以实际开工时间作为工期的起算点，工期向后顺延相应迟延开工的时间。

2、虽然进场，但开工条件不具备的。如达不到开工的客观条件或者法定条件，如工地未满足合同约定的开工要求，法律上相关审批手续未办妥等。

3、发包人未按合同约定时间提供符合要求的图纸的。

4、发包人未按合同约定支付工程款的。

5、发包人或者监理未及时发出指令、确认或进行答复的。

6、设计变更，导致工程量增加的。

7、发包人提供的测量基准点、基准线和水准点、勘察报告及其他书面资料存在错误或疏漏的。

8、发包人增加合同外工程的，该工程另行计算工期，在原合同工期中顺延。

9、非发包人原因造成停水、停电、停气等累计超过8小时的（本条在2013版施工合同中已经删除，所以本条并非必然可以顺延工期的情形，部分合同专用合同条款中已约定停水、停电、停气的风险由承包人承担）。

10、发包方供应材料的，因发包供应材料迟延造成工期延误的。

11、不可扩抗力，如台风造成、政府指令（如高考、召开重要会议）要求停工等。

12、非承包人原因而发包人要求停工的。

13、非承包人原因而监理单位指令停工的。

14、承包人按合同约定程序完成隐蔽工程后发包人要求开挖重新验收，且验收结合格的。

15、发包人直接发包工程的施工人原因造成工期延误的。

16、发包人与承包人在施工过程中因已完成工程质量产生争议，承包人为避免损失扩大暂停施工，但最终确定已完成工程质量合格的。

17、发包人未协调好土地权属问题、相邻关系等问题，相关第三人影响承包人正常施工的。

18、因异常恶劣气候但未达到不可抗力情形下造成工期延误的。

19、不利物质条件但未达到不可抗力情形下造成工期延误。

20、其他因发包方原因造成工期延误的情形。

发生这些情况下，理论上来说均可以要求顺延工期。当然在实践能否顺延工期、顺延工期后能否在法律上得到支持、能否据此进行索赔（工期延误与索赔是相应关联一对概念）还是一个非常复杂的问题。因为一方面需要具体问题具体应对，另一方面工期的顺延还涉及顺延程序、证据固定、索赔权利的主张等系列的问题。