实际履行的合同可能签订于中标之后，也可能签订于中标之前。取消施工合同备案产生的影响将因实际履行合同签订时间的不同而有所差异。

实际履行合同签订于中标之后。《招标投标法》第12条规定：“依法必须进行招标的项目，招标人自行办理招标事宜的，应当向有关行政监督部门备案。”《招投标办法》第18条(修改后的条文序号)规定：“依法必须进行施工招标的工程，招标人应当在招标文件发出的同时，将招标文件报工程所在地的县级以上地方人民政府建设行政主管部门备案。建设行政主管部门发现招标文件有违反法律、法规内容的，应当责令招标人改正。”

在此次改革中，仅仅取消了施工合同的备案，并未取消招标文件的备案。因此，招标文件仍然依法应当经过建设行政主管部门的审查备案。

在招标文件的备案程序中，建设行政主管部门往往会对招标文件中的内容进行较为严格的实质性审查，对于其中部分不符合有关规定及要求的内容，主管部门将依据《招投标办法》第18条的规定责令改正。

现在我国基本上已经在各地都取消了施工合同的备案，因此也就不存在施工合同备案需要缴纳费用的说法了，但是如果有些地区还在要求施工，合同备案也是合法的，但是施工合同备案不需要缴纳任何费用，只需要当事人提前在网上进行申报，然后上传资料等待审批，最后办理即可。

一、建筑施工合同实际合同与备案合同不一致

建设工程领域中的“黑白合同”是指建设工程施工合同的当事人就同一建设工程签订的两份或两份以上实质性内容相异的合同。通常把经过招标、投标经备案的正式合同称为“白合同”，把实际履行的补充协议称为“黑合同”。中标通知书对招标人和中标人具有法律效力，中标通知书发出后，招标人改变中标结果的或者中标人放弃中标项目的，应当依法承担法律责任。

也就是说中标通知书一旦到达投标人，合同即成立招标人和中标人应当自中标通知书发出之日起30日内，按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同。招标人和中标人不得再行订立背离合同实质性内容的其他协议。备案与否在工程款结算方面有很大影响。

《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第二十一条规定：当事人就同一建设工程另行订立的建设工程施工合同与经过备案的中标合同实质性内容不一致的，应当以备案的中标合同作为结算工程价款的根据。