施工合同与备案合同金额不一致的，应当以备案的中标合同作为结算工程价款的根据。

《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》

第二十一条当事人就同一建设工程另行订立的建设工程施工合同与经过备案的中标合同实质性内容不一致的，应当以备案的中标合同作为结算工程价款的根据。

一、施工合同备案多久办理完成

签订施工合同在订立后7日即可办理备案完成，施工合同是必须要备案的，否则一旦产生纠纷和争议，没有备案的合同是不具备法律效应的。中标人应当将合同送工程所在地的县级以上地方人民政府建设行政主管部门备案。法律对于建设工程合同的备案有具体的规定，《房屋建筑和市政基础设施工程施工招标投标管理办法》第47条规定：“订立书面合同7日内，中标人应当将合同送工程所在地的县级以上地方人民政府建设行政主管部门备案。”根据法律的相关规定，建筑工程合同备案的流程和要求较为严格，备案后查询更有利于纠纷的解决。

二、合同外增加工程量怎么处理

建设合同以外增加了工程量的，当事人协商不一致时，可以参照签订建设工程施工合同时当地建设行政主管部门发布的计价方法或者计价标准结算工程价款。

《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释(一)》

第十九条当事人对建设工程的计价标准或者计价方法有约定的，按照约定结算工程价款。

因设计变更导致建设工程的工程量或者质量标准发生变化，当事人对该部分工程价款不能协商一致的，可以参照签订建设工程施工合同时当地建设行政主管部门发布的计价方法或者计价标准结算工程价款。

建设工程施工合同有效，但建设工程经竣工验收不合格的，依照民法典第五百七十七条规定处理。

第二十条当事人对工程量有争议的，按照施工过程中形成的签证等书面文件确认。承包人能够证明发包人同意其施工，但未能提供签证文件证明工程量发生的，可以按照当事人提供的其他证据确认实际发生的工程量。

三、建设工程施工纠纷是怎样的

建设工程施工纠纷包括以下几个方面：

1、合同效力及相关问题。例如背离中标合同实质性内容的认定。

招标人和中标人另行签订的建设工程施工合同约定的工程范围、建设工期、工程质量、工程价款等实质性内容，与中标合同不一致，一方当事人请求按照中标合同确定权利义务的，人民法院应予支持。

2、工程价款结算问题。开工日期、完工日期、竣工验收日期。工期在施工合同中进行了约定，在示范合同文本中也同时有工期顺延、工期延误的相关条款。发包人常用来抗辩承包人请求支付工程进度款或结算的一个主要理由就是承包人承担工期延误违约金。

3、实际施工人的权利救济问题。实际施工人可以起诉发包人。建筑市场转包、违法分包现象很多，实际施工人与发包人没有直接的合同关系，而签订合同的承包人往往收取了一定的管理费后，不去进行结算或者不积极主张权利，实际施工人无法从发包人处取得工程款，也就连锁影响到农名工的工资报酬无法及时足额取得，所以，规定可以直接向发包人主张权利，有利于维护农民工利益。但发包人只在欠付工程款范围内对实际施工人承担责任。