1、这个需要具体问题具体分析，并不是所有的违章建筑都不能给予拆迁补偿，也就是说建筑违章，但建筑材料是违章建筑人的合法财产，既在拆迁补偿中要注意区分违章建筑和建筑使用的材料。

2、建筑违章但土地具有合法的使用权或产权也要给予适当的补偿，如果因拆迁造成土地使用收益损失应予以适当补偿。在拆迁补偿中，要注意区分违章建筑和建筑范围内的土地使用权。

3、在拆迁补偿中，要注意区分违章建筑和建筑内的财产。违章建筑内的财产可以独立于违章建筑存在，系违章建筑人的合法财产，依法应当受到保护。拆迁人在拆除违章建筑的过程中，不得侵犯违章建筑人的违章建筑内的合法财产权益，否则应当承担法律责任。

4、在拆迁补偿中，要注意区分拆迁补偿款和拆迁补助费。虽然我国《城市拆迁管理条例》明确规定：拆除违章建筑不予补偿，但是这只能说明违章建筑人不能获得拆迁补偿款，拆迁人仍要依法向违章建筑人支付拆迁补助费。拆迁补助费包括搬迁补助费和临时安置补助费等其它费用。拆迁人不得因违章建筑拒绝向违章建筑人支付搬迁补助费和临时安置补助费等费拆迁补助费的请求。

5、在拆迁补偿中，要注意转化的违章建筑的特殊情况。所谓转化的违章建筑，主要是指因为超过批准期限，由临时建筑转化成的违章建筑。转化的违章建筑和批准期限内的临时建筑的区分点就是批准期末，批准期初至批准期末为合法建筑，超过批准期末，仍未拆除的，为违章建筑。

一、拆除违章建筑的流程

第一步，拆除违章建筑的流程——立案

立案就是执法部门对于发现或接到投诉、举报等事实或者材料后，认为有违法事实发生或存在并需要追究法律责任时，决定把它作为行政案件进行查处的一种活动。

第二步，拆除违章建筑的流程——调查程序

第三步，拆除违章建筑的流程——决定程序

第四步，拆除违章建筑的流程——处罚决定书的送达和执行。

执法机关如果决定要进行处罚，会作出并向被处罚人送达《行政处罚决定书》。

相关法律规定：

《城市房屋拆迁管理条例》

第二十二条：拆迁人应当依照本条例规定，对被拆迁人给予补偿。拆除违章建筑和超过批准期限的临时建筑，不予补偿；拆除未超过批准期限的临时建筑，应当给予适当补偿。