会，但这种影响是民事权利义务上的影响而一般不涉及行政或者刑事。员工如果因为与公司存在劳动争议而向劳动仲裁委申请劳动仲裁，则仲裁委受理后，公司将成为劳动仲裁的被申请人，需要参与到仲裁当中，并且受到劳动仲裁的裁决的约束。可能会需要对劳动者进行经济上的补偿、赔偿或其他。

一、入职3个月辞退怎么给补偿

（一）属于公司辞退行为

（二）经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。

无理由辞退，两倍赔偿可以和工作年限叠加赔偿，强行辞退是无法拒绝的，只能通过合法的维权要求赔偿。你可以通过以下途径解决：

1、可以向本单位劳动争议调解委员会申请调解。劳动争议调解委员会由职工代表、用人单位代表和工会代表组成，劳动争议经调解达成协议的，当事人应当履行。

2、调解不成的，向劳动仲裁委员会提起劳动仲裁。当事人也可直接向劳动仲裁委员会提起仲裁，调解并不是劳动仲裁的必经程序。提出仲裁要求的一方应当自劳动争议发生之日起六十日内向劳动争议仲裁委员会提出书面申请。仲裁裁决一般应在收到仲裁申请的六十日内作出。对仲裁裁决无异议的，当事人必须履行。劳动仲裁裁决具有强制执行力，当事人一方不履行裁决的，另一方可以向劳动仲裁委员会所在地的法院提起强制执行申请。由此可以看出，仲裁与调解相比，有更强的司法保障力。

3、对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。此处需要提醒大家：仲裁是诉讼的必经程序，当事人未经劳动仲裁委员会裁决，而直接向法院提起诉讼的，人民法院不予受理。向法院提起诉讼的期限为：自接到劳动仲裁裁决书之日起十五日内。

二、劳动仲裁确认不存在劳动关系

企业与员工不存在劳动关系，只能通过事实来证明，如果有证据不符合事实也是无效的。劳动仲裁裁决书判定不存在劳动关系，要么是证据不足，要么是没有劳动关系，可能是劳务关系。如果用人单位不给劳动者工资的，双方当事人有劳动争议的，是可以向劳动仲裁委员会申请劳动仲裁的，劳动仲裁委员会是需要依法作出相关的裁判的。先调后仲再诉。

三、最新离职协议签字了还能劳动仲裁吗

离职协议签字了，如果发生的劳动争议在仲裁范围内的，还能申请劳动仲裁。

用人单位没有按照协议约定支付应有的经济补偿金或者工资以及相关待遇，侵犯了劳动者的合法权益的，只要在一年的仲裁时效内，劳动者就可以申请劳动仲裁。当事人向仲裁委员会提交劳动仲裁申请书，经审查，仲裁委员会收到劳动仲裁申请书之日起五日内作出受理或者不予受理的决定。

决定不予受理的，应自作出决定之日起五日内制作不予受理通知书，送达申请人；决定立案的，应自作出决定之日起，五日内向申请人和被申请人发出书面通知，同时将申请书副本送达被申请人，并要求其在十日内提交答辩书和证据。

被诉人不提交答辩书的，不影响案件审理。职工一方在十人以上的集体劳动争议，仲裁委员应自收到申诉书之日起三日内作出受理或者不予受理的决定。仲裁委员会决定受理的，用通知书或布告形式通知当事人。

劳动仲裁的流程是：

1、提交立案材料：当事人申请仲裁，应当提交书面仲裁申请书、身份证复印件、证据清单、公司的工商登记信息等；

2、仲裁受理：仲裁委员会应当自收到仲裁申请之日起五个工作日内作出受理或者不予受理的决定。仲裁委员会决定受理的，应当自作出决定之日起五日内将劳动仲裁申请书副本送达被申请人。决定不予受理的，应当说明理由；

3、开庭审理：仲裁庭应当于开庭的五日前，将开庭日期、地点书面通知双方当事人。无正当理由拒不到庭或者未经仲裁庭同意中途退庭的，对申请人按照撤诉处理，对被申请人可以做缺席裁决；

4、仲裁调解：双方达成调解意见的，仲裁庭应当制作调解书。我远程代理的案件，大部分都在劳动仲裁阶段达成了调解。当然，一般调解在金额上需要做一些让步。这样更快拿到钱，降低风险和时间的投入；

5、仲裁裁决：如果双方调解不成。那么仲裁委会在开庭后一段时间内给双方出具裁决书。双方收到裁决书15天内，可以起诉到法院。不起诉的，裁决书生效；

6、强制执行：如果对方不履行劳动仲裁裁决书或调解书，那么当事人可以去法院执行庭申请强制执行。执行费由被执行人承担。执行期间，按照贷款利率计息。