(一)在实践中，把握生产、销售有毒、有害食品罪罪与非罪的界限应当注意以下几点：

(1)是否违反食品卫生法规，尤其注意是否违反《食品卫生法》。违反食品卫生法规是构成本罪的前提，不违法就不构成犯罪。

(2)生产销售的食品是否有毒、有害的食品。判断食品中是否有毒、有害，要由专业的食品卫生监督机关进行鉴定。如果无毒、无害或者毒性很小，危险性也很小，则不构成犯罪。

(3)行为人主观上是否出于故意。如果行为人出于过失，不知道生产销售的食品是有毒、有害的食品且没有造成严重后果，则不构成犯罪。

(二)本罪与生产、销售不符合卫生标准的食品罪界限。

两罪在犯罪客体、主体和主观方面具有相同或者相似之处。广义上来说，掺入有毒有害的非食品原料的食品本身也是一种不符合卫生标准的食品。但生产、销售有毒、有害食品罪与生产、销售不符合卫生标准的食品罪的主要区别在于：

(1)犯罪的对象不同。犯罪对象是含有有毒、有害物质，可能对消费者即不特定多数人的生命、健康权利造成不利影响的食品;而生产、销售不符合卫生标准的食品罪的犯罪对象则要广泛得多，主要是不符合卫生标准的食品。

(2)犯罪客观方面的行为不同。本罪在客观方面表现对在生产、销售的食品掺入有毒、有害的非食品原料或者销售明知掺有有毒、有害的非食品原料的食品的行为;生产、销售不符合卫生标准的食品的客观方面表现为食品中掺杂、掺假，以假充真，以次充好或者以不合格食品冒充合格食品的行为。

(3)生产、销售有毒、有害食品罪是行为犯罪，不要求必须有实害结果的发生;生产、销售不符合卫生标准的食品罪是危险犯罪，只要出现法定的危险状态，就构成该犯罪的既遂。

(三)本罪与投放危险物质罪的界限。

投放危险物质罪是指故意投放有毒性、放射性、传染病病原体等危险物质，危害公共安全的行为。投放危险物质罪中的投放有毒性物质的行为和生产、销售有毒、有害食品罪在客观方面都使用了毒物，并且均危害了公共安全，有一定的相同或者相似之处。但它们的区别也是明显的，主要是：

(1)犯罪客体不尽相同。投放危险物质罪的客体为公共安全;本罪的客体为复杂客体，具体包括国家对食品卫生的监督管理秩序和广大消费者即不特定多数人的生命、健康权利。

(2)犯罪客观方面不尽相同。投放危险物质除了可以在食品中投放有毒物质外，也可以在其他场合投放有毒物质;本罪在客观方面表现为在生产、销售的食品中掺入有毒、有害的非食品原料或者销售明知掺有有毒、有害的非食品原料的食品。

(3)犯罪主体不尽相同。投放危险物质的主体为一般主体且只能是自然人，14周岁以上的人可以构成投放危险物质罪;本罪的主体为生产者、销售者，既可以是年满16周岁的自然人，也可以是单位。