公司破产清算的程序是：

一、成立清算组。人民法院应当在宣告企业破产之日起十五日内成立清算组，接管破产企业，清算组应当由股东、有关机关及专业人士组成；

二、清算组接管破产公司。人民法院宣告企业破产后，破产企业由清算组接管，负责对破产企业的财产进行管理、清理、估价、处理、分配，代表破产企业参与民事活动，其行为对人民法院负责并汇报工作；

三、破产财产分配。分配破产财产，由清算组提出分配方案，在债权人会上讨论通过，报人民法院批准后由清算组具体执行；清算组分配破产财产前，首先应拨付清算费用，包括：破产财产管理、变卖、分配所需的费用；破产案件诉讼费；为债权人的共同利益而在破产程序中支付的其他费用。破产财产在优先支付清算费用后，按以下顺序清偿：破产企业拖欠的职工工资、劳动保险费用；破产企业拖欠税款；破产债权。

四、清算终结。破产财产清算分配完毕，由清算组向人民法院汇报清算分配工作的情况，并申请人民法院裁定破产终结，未得到清偿的债权，不再进行清偿；

五、注销登记。企业破产，破产财产分配完毕，企业法人依法终止其民事行为能力，清算组向破产公司的原登记机关申请注销原公司登记。根据商标法的规定，在发生注册商标专用权侵权案件时，商标注册人或者利害关系人可以向人民法院起诉，也可以请求工商行政管理部门处理。其中，利害关系人包括注册商标使用许可合同的被许可人、注册商标财产权利的合法继承人等。根据最高人民法院《关于审理商标民事纠纷案件适用法律若干问题的解释》的规定，在发生注册商标专用权侵权案件时，独占使用许可合同的被许可人可以向人民法院提起诉讼。独占使用许可合同的被许可人享有独立的诉权。独占使用许可破产清算的含义是指受让人在规定的范围内享有对合同规定的专利技术的使用权，让与人或任何第三方都不得同时在该范围内具有对该项专利技术的使用权。按照这一合同，专利权人允许被许可人在一定的期限和地域范围内享有独占使用其专利的权利，被许可人按照约定的数额支付给专利人使用费。这种合同要求专利权人在规定的时间和地域范围内，不但不能许可第三者使用该专利而且自己也不得使用。独占使用许可，是指商标注册人在约定的期间和以约定的方式，将该注册商标仅许可一个被许可人使用，商标注册人依约定不得使用该注册商标，而在破产清算的时候也会受到影响。