按照相关规定，自然人股权转让行为，转让方需要按“财产转让所得”计征个人所得税。

即：以转让股权的收入额减除原值和合理费用后的余额，适用百分之二十的比例税率，计算缴纳个人所得税。

但是，如果转让方以原价转让的，不交个人所得税。

股东变更程序

1、法定代表人签署的《公司变更登记申请书》（领取，公司加盖公章）；

2、《企业（公司）申请登记委托书》（领取，公司加盖公章），应标明具体委托事项和被委托人的权限；

3、有限责任公司变更股东提交原股东会决议（内容包括：转让双方当事人、转让标的、数额，其他股东优先受让权力的行使情况等，由股东盖章或签字（自然人股东）；

国有独资公司有限责任公司变更出资人提交国务院或者国务院授权的机构、部门转让出资的文件。

4、转让双方签署的股权转让协议；

5、有限责任公司变更股东提交新股东会决议（内容包括：新的股东会成立，修改公司章程，决定是否调整经营管理机构由股东盖章或签字（自然人股东）；

股份有限公司变更股东提交新股东会决议（内容包括：新的股东会成立，修改公司章程，决定是否调整经营管理机构，由发起人盖章或者出席会议的董事签字）。

6、章程修正案：

有限责任公司由股东盖章或签字（自然人股东）；

股份有限公司由发起人盖章或出席会议的董事签字；

国有独资有限责任公司由投资人盖章。

7、新股东或发起人股受让人或者国有独资有限责任公司出资人的法人资格证明或自然人身份证明；

企业法人提交营业执照复印件；事业法人提交事业法人登记证书复印件；社团法人提交社团法人登记证复印件；民办非企业提交民办非企业证书复印件；自然人提交身份证复印件。

变更后的股东或发起人股受让人是外商投资企业的，如公司的经营范围属于鼓励或允许外商投资的领域的，外商投资企业股东或发起人股受让人应提交：外商投资企业关于投资一致通过的董事会决议；外商投资企业的批准证书和营业执照复印件；法定验资机构出具的注册资本已经缴足的验资报告；外商投资企业经审计的资产负债表；外商投资企业缴纳所得税或减免所得税的证明；法律、行政法规及规章规定的其它材料。

变更后的股东或发起人股受让人是外商投资企业的，如公司的经营范围属于限制外商投资的领域的，除外商投资企业股东或发起人股受让人应提交上述规定提交材料外：公司还应提交省级以上外经贸主管部门的批准文件。

8、法律、行政法规规定公司变更股东或发起人应报经审批的，提交有关部门的批准文件；

9、公司营业执照正副本。

注：依照公司登记管理条例设立的公司申请股东、发起人变更或者股份转让的变更登记适用本规范。

《个人所得税法》第三条

个人所得税的税率：

（一）综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率；

（二）经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率；

（三）利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，适用比例税率，税率为百分之二十。