发明专利申请在实质性审查过程中被驳回的原因：

1、申请的主题不是发明；

2、申请的主题违反国家法律、社会公德或者妨碍公共利益；

3、申请的主题属于不授予专利权的技术领域；

4、申请的主题不新颖、不创造、不实用；

5、申请的主题不符合同一发明创造只能授予一项专利的规定；

6、申请人不是本发明首先提出的专利申请人；

7、申请说明书对发明创造没有明确、完整的说明，申请的权利要求书没有按照说明书说明专利保护的范围；

8、申请的主题不符合发明专利申请单一性要求的规定；

9、修改申请文件或者分案申请超出原说明书或者权利要求书记载的范围。

商标被驳回的原因

1、他人注册在先

商标局审查员在进行审查工作时，首先会对商标局数据库现有的商标信息进行对比，发现同一名称同一类的商标，这根据“在先申请原则”对你注册的商标予以驳回处理。为了防止恶意抢注，我国《商标法》第三十二条规定，申请商标注册不得损害他人现有的在先权利，也不得以不正当手段抢先注册他人已经使用并有一定影响的商标。

2、商标近似被驳回

两个商标在文字字形、读音、含义、图形的构图及颜色、整体结构、立体形状、颜色组合近似，容易令公众产生误认或混淆的，一般会被认定为近似商标而被驳回。

3、商标名称属于通用名称、描述性词语

行业内通用的名称以及仅仅描述了产品特征的词语是不能作为商标注册的。第十条第七款“带有欺骗性，容易使公众对商品的质量等特点或者产地产生误认的”，第十一条第一款“仅有本商品的通用名称、图形、型号的”等等，这些都是非常容易产生争议的地方。

4、商标缺乏显著特征

当申请的商标过于简单，如使用简单的线条、普通几何图形时，审查员会认为该商标缺乏显著特征，不具备可识别性，而被驳回。

5、使用了不被允许注册的标志

《商标法》规定了包括中华人民共和国的名称、国旗、国歌在内的若干种不可作为商标注册使用的标志，其中，地名以及容易使公众对商品质量、产地产生误认的名称或标志都不可注册为商标，若不小心使用了不被允许的标志作为商标注册，则会被驳回，不予注册。

《中华人民共和国专利法》第二十六条申请发明或者实用新型专利的，应当提交请求书、说明书及其摘要和权利要求书等文件。

请求书应当写明发明或者实用新型的名称，发明人的姓名，申请人姓名或者名称、地址，以及其他事项。

说明书应当对发明或者实用新型作出清楚、完整的说明，以所属技术领域的技术人员能够实现为准；必要的时候，应当有附图。摘要应当简要说明发明或者实用新型的技术要点。

权利要求书应当以说明书为依据，清楚、简要地限定要求专利保护的范围。

依赖遗传资源完成的发明创造，申请人应当在专利申请文件中说明该遗传资源的直接来源和原始来源；申请人无法说明原始来源的，应当陈述理由。