侵占罪是否由检察院应当根据案件的实际而定，如果涉及到国家工作人员职务侵占的则属于检察院直接批捕。在我国，公安机关，人民检察院，人民法院各司其职。公安机关：负责刑事案件侦查、拘留、执行逮捕、预审。检察院：负责对执行法律的检察、对犯罪嫌疑人的批准逮捕、提起公诉，以及检察机关直接受理的案件的侦查、提起公诉。法院：负责刑事诉讼案件的审判。

首先侵占罪是由公安机关管辖，检察院只管辖国家工作人员的犯罪。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十八条规定：刑事案件的侦查由公安机关进行，法律另有规定的除外。

贪污贿赂犯罪，国家工作人员的渎职犯罪，国家机关工作人员利用职权实施的非法拘禁、刑讯逼供、报复陷害、非法搜查的侵犯公民人身权利的犯罪以及侵犯公民民主权利的犯罪，由人民检察院立案侦查。对于国家机关工作人员利用职权实施的其他重大的犯罪案件，需要由人民检察院直接受理的时候，经省级以上人民检察院决定，可以由人民检察院立案侦查。

自诉案件，由人民法院直接受理。

一、侵占罪告诉处理的程序

刑法第270条第3款规定，对于侵占罪告诉才处理。即国家司法机关对侵占罪采取不告不理的原则，只有被害人告诉的，司法机关才能开始追究侵占罪行为人的刑事诉讼活动。因此，对侵占罪的告诉问题应注意以下几个方面：

(一)告诉的主体。

一般情况下，侵占罪的告诉人应是被害人。但是如果被害人因受强制、威吓无法告诉的，人民检察院和被害人的近亲属也可以告诉。

(二)告诉的对象。

被害人应向谁告诉侵占罪？根据刑事诉讼法第84条的规定，被害人对侵犯其人身、财产权利的犯罪事实或者犯罪嫌疑人有权向公安机关、人民检察院或者人民法院报案或者控告。公安机关、人民检察院或者人民法院对于报案、控告、举报，都应当接受。对于不属于自己管辖的，应当移送主管机关处理。被害人向公安机关、人民检察院、人民法院中任何一司法机关告诉的，都应视为已经告诉。

(三)侵占罪的诉讼形式。

根据最高人民法院关于执行《中华人民共和国刑事诉讼法》若干问题的解释(1998年23号)第一条的规定，侵占案属于人民法院直接受理的自诉案件，而不属于公诉案件的范畴，因此，侵占案件只能由人民法院直接受理，并按自诉案件审理程序进行审理。