如果双方对医疗纠纷不能自行协商解决，当事人可以申请卫生行政部门行政处理，第三方调解（例如人民调解委员会），向法院依法起诉。所以，卫生行政部门、调解委员会以及法院都有处理医疗纠纷的权限。

医疗纠纷处理程序是什么的法律依据：

《医疗事故技术鉴定暂行办法全文》第十一条

协商解决医疗事故争议涉及多个医疗机构的，应当由涉及的所有医疗机构与患者共同委托其中任何一所医疗机构所在地负责组织首次医疗事故技术鉴定工作的医学会进行医疗事故技术鉴定。医疗事故争议涉及多个医疗机构，当事人申请卫生行政部门处理的，只可以向其中一所医疗机构所在地卫生行政部门提出处理申请。

一、医疗纠纷处理程序是什么

1、当发生医疗纠纷时，科室必须保管好病案，不得丢失、涂改、外借。

2、科主任对本科内出现的医疗纠纷负责，医疗纠纷出现后科主任首先负责接待投诉的病人或家属，了解投诉内容，进行调查。能够当时答复者，给予准确的解释。当时无法答复或需调查后答复的应明确告知病人或家属下一次的接待时间和地点，同时向医教部报告。

3、患者死亡后出现医疗纠纷时，主管医师或值班医师会同上级医师，必须向家属明确提出是否做尸体解剖及48小时内完成，并在病程记录中完整的将家属是否同意做尸体解剖的意见记录在案，请家属签字。如家属拒绝做尸体解剖，必须请直系亲属在病历中写明不同意尸检并签字。

4、当患者家属提出封存复印病历时，正常上班时间报医教部，非正常上班时间报总值班。封存运行病历应是在医务人员陪同家属共同复印的病历复印件，客观病历患者家属可复印，主观病历患者家属不可复印，应封存复印件。

5、当科室在解决医疗纠纷时未能与患者／家属取得一致时，由医教部、治安办接待并继续解决。医教部依据患者家属提出的口头或书面意见组织相关科室人员进行调查讨论，必要时须经医院医疗事故鉴定委员会进行鉴定。

6、医教部在接待医疗纠纷中，被投诉科室科主任必须在场，如因特殊情况不在时，应向医教部报告后，可委托副主任医师以上的专业医师现场负责对对投诉者提出的有关专业问题的解答。

7、发生医疗纠纷，我院在接到病人家属投诉之日起，在七个工作日将结果答复病人或家属。

8、当投诉者对我院医疗鉴定结论不服时，须按有关程序向上级医疗事故鉴定委员会申请医学鉴定。

9、医务人员在接待医疗纠纷的投诉者时，应耐心、认真听取意见，合理科学的，用较通俗的语言做恰如其分的解释工作，以取得家属／患者的配合。

10、接待医疗纠纷时，应询问来访者是否为患者被法律承认的直系家属，以利医疗纠纷解决和合法性。