行政诉讼鉴定证据的认定方式是：证据应当在法庭上出示，并由当事人互相质证，涉及国家秘密、商业秘密和个人隐私的除外；提交的证据按照法定程序，全面、客观地审查核实；以非法手段取得的证据，不得作为认定案件事实的根据。

二、交通事故起诉程序是怎样的

(一)起诉和受理交通事故当事人就损害赔偿提起诉讼的，应向法院递交起诉状，经法院审查符合起诉条件的，受理后七日内立案;认为不符合条件的，在七日内裁定，不服的可提起上诉。(二)审理前的准备法院立案后五日内将起诉状附本发送被告，被告应在15日内提答辩状，法院组成合议庭审检诉讼材料进行必要的审理前的准备工作。(三)开庭审理1、开庭三日前通知诉讼参与人。2、审理前核对讼诉参与人，宣布法庭纪律，告知当事人有关讼诉权利与义务，询问是否提出回避申请。3、法庭调查。(1)当事人陈述起诉请求和理由。(2)证人作证知道案件情况的单位和个人都有义务作证。(3)出示证据。(4)宣读鉴定结论。(5)宣读勘验笔录。(6)当事人在法庭上可以提出所有的证据。(7)质证双方就赔偿争议所得供的证据应互相质证。4、法庭辩论，原告发言，被告答辩，第三人发言及答辩后互相答辩。5、法庭辩论终结，双方当事人争议核实清楚后法庭调查结束，应依法作出判决。6、法庭能够调解的进行调解，调解不成的应及时判决。普通程序的审判应当在立案之日起6个月内审结，有特殊情况需要延长的，由本院院长批准，可以延长6个月;还需要延长的，需要报请上级人民法院批准。

三、法院质证是指什么

法院质证是指当事人、诉讼代理人及第三人在法庭的主持下，对当事人及第三人提出的证据就其真实性、合法性、关联性以及证明力的有无、大小予以说明和质辩的活动或过程。

广义的质证通常指在诉讼或仲裁活动中，一方当事人及其代理人对另一方出示的证据的合法性、与本案争议事实的关联性、真实性，是否有证明力，是否可以作为本案认定案件事实的根据，进行的说明、评价、质疑、辩驳、对质、辩论以及用其他方法表明证据效力的活动及其过程。狭义的质证仅指诉讼活动中，在证据交换程序中或在法庭审理过程中的法庭调查阶段，进行的前述活动。

质证制度的意义在于，通过质证程序使审理更加公开、法院能够正确地认定证据、保障当事人的程序权利。

证据规定第四十七条规定，证据应当在法庭上出示，由当事人质证。未经质证的证据，不能作为认定案件事实的依据。

质证不同于诉讼中的对质，对质，是指在庭审中，双方当事人各自申请的具有专门知识的人相互之间就其对案件事实中专门问题的认识所进行的说明和质辩。

对质与质证的相同点在于，两者都是在双方之间展开的行为，其行为都表现为对某一对象的说明和质辩，两者都涉及案件的事实。不同的是，质证是在当事人、诉讼代理人、第三人之间进行，而对质则是在案外的具有专门知识的人之间进行的，对质的目的是便于法院通过比较获得对专门问题的正确认识，而质证的目的在于法院正确认定证据。