合同主体变更属于重大事项改变，需要和员工协商，员工不同意续签，按照法律规定解除劳动合同。

第三十四条用人单位发生合并或者分立等情况，原劳动合同继续有效，劳动合同由承继其权利和义务的用人单位继续履行。

第四十六条有下列情形之一的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿：(五)除用人单位维持或者提高劳动合同约定条件续订劳动合同，劳动者不同意续订的情形外，依照本法第四十四条第一项规定终止固定期限劳动合同的，所以，主动离职的并不会支付补偿金。

经济补偿金计算方法：

1.年限计算标准

按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算;不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。

工作年限，应从劳动者向该用人单位提供劳动之日起计算。没有及时签订劳动合同的，不影响工作年限的计算，应该从形成事实劳动关系算起。续签过几份劳动合同的，工作年限应从第一份劳动合同的起始时间开始算起，即自劳动者提供劳动之日起连续计算。此外，根据规定，对于因分立、合并、合资人、单位改变性质、法人改变名称等原因而改变工作单位的，其改制前的工作时间可以计算为“在本单位的工作时间”。

还有，《劳动合同法》规定经济补偿近“本单位工作的年限”，而不是“本单位连续工作年限”。

去掉连续两个字就变成累积，不再是连续了。这一变化说时《劳动合同法》在计算工作年限时已经不再局限于“连续工作年限”了，即使劳动关系有中断，也可合并计算工作年限。因些，企业在招聘的时候最好要详细审查求职者是否曾在本企业工作过。

此外，还要注意，在我国法律中，“以上”、“以下”、“以内”、“届满”，一般包括本数;因此，工作时间刚好六个月的，经济补偿按照一年工资计算。

2.计算工资基数

劳动合同法简化了工资的计算标准，规定工资是指劳动进在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。

必须注意，这里的工资是指劳动者的应得工资，一般包括：计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、加班加点工资、特殊情况下支付的工资。具体规定可参照《工资总额组成规定》。有些企业以劳动者的所谓“最低工资”或者“基本工资”作为工资计算基数，这是不对的。

3.针对高工资收入者的计算封顶

《劳动合同法》规定，劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本草纲目区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，身其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。

注意，《劳动合同法》只是对高改者的经济补偿作了补偿年限和补偿基数的限制，对于普通劳动者是没有限制的。只要劳动者月工资不高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资的三倍，就不存在“三倍”和“十二年”的计算封顶。

4.个人所得税

根据规定，个人因与用人单位解除劳动关系而取得的一次性补偿收入，其收入在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，免征个人所得税。

5.与经济补偿金有关的过渡期规定

《劳动合同法》第九十七条规定，本法施行之日存续的劳动合同在本法施行后解除或者终止，依照本法第四十六条规定应当支付经济补偿的，经济补偿年限自本法施行之日起计算;本法施行前按照当时有关规定，用人单位应当向劳动者支付经济补偿的，按照当时有关规定执行。